More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2176 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  100 
 
 		 288 aa  588  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  42.96 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  44.76 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  41.7 
 
 		 282 aa  216  5e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  39.78 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  46.46 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  38.73 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  41.2 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4319  modification methylase, HemK family  40.15 
 
 		 286 aa  195  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  41.84 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  37.37 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  39.72 
 
 		 277 aa  169  7e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  37.46 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  35.14 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  39.06 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.85 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.4 
 
 		 297 aa  158  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  36.16 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  37.05 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  34.73 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  37.07 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.8 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  39.56 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  38.4 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  37.8 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  33.45 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.54 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  36.36 
 
 		 359 aa  142  7e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.5 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  35.34 
 
 		 361 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  37.21 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1660  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.59 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  34.47 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  35.78 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  34.11 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  33.85 
 
 		 288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.93 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  34.24 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  35.47 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  35.94 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  37.41 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  33.6 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1724  HemK family modification methylase  32.97 
 
 		 278 aa  132  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  34.77 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  33.46 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  36.11 
 
 		 275 aa  132  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  34.77 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.52 
 
 		 279 aa  132  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  34.77 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.73 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.8 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  34.77 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  31.75 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  35.02 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.77 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  33.6 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.77 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.41 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  32.66 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  32.18 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  33.11 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.91 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  33.76 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.77 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  31.62 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  33.57 
 
 		 298 aa  126  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  31.62 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.55 
 
 		 286 aa  126  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.71 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  35.27 
 
 		 284 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  32.2 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.6 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2153  HemK family modification methylase  33.05 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200302  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  33.09 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2191  HemK family modification methylase  33.05 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.961515  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  32.33 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  34.8 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  34.98 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  34.98 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  34.98 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  34.98 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  34.98 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  34.98 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  34.98 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  31.06 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  34.17 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  36.77 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  34.7 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  33.21 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  32.96 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1247  methylase of polypeptide chain release factor  32.69 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  31.8 
 
 		 587 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  32.95 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  33.2 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  30.83 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  33.2 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  31.42 
 
 		 587 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  32.79 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  34.73 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>