33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2158 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2158  translation elongation factor P (EF-P)  100 
 
 		 161 aa  336  7e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401757  normal  0.635134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5023  hypothetical protein  34.03 
 
 		 160 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5198  hypothetical protein  35.42 
 
 		 160 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2917  hypothetical protein  31.97 
 
 		 150 aa  94  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.389629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5105  hypothetical protein  35.42 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0979763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68970  hypothetical protein  33.77 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5258  hypothetical protein  34.72 
 
 		 160 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5432  hypothetical protein  30.56 
 
 		 161 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1855  hypothetical protein  33.09 
 
 		 164 aa  90.5  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5965  hypothetical protein  33.12 
 
 		 160 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1689  hypothetical protein  32.88 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000692743  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2058  hypothetical protein  36.3 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1465  hypothetical protein  37.4 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01340  hypothetical protein  28.76 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0956  hypothetical protein  28.26 
 
 		 141 aa  85.1  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01871  lipoprotein, putative  33.1 
 
 		 223 aa  85.1  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1255  hypothetical protein  32.65 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.641108  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0090  hypothetical protein  32.54 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1327  hypothetical protein  34.27 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004125  hypothetical protein  32.89 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000493845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3579  hypothetical protein  33.1 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1802  hypothetical protein  27.92 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0975  hypothetical protein  33.62 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.149641  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0834  hypothetical protein  27.33 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3511  hypothetical protein  32.86 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00290  hypothetical protein  27.78 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2166  hypothetical protein  28.77 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0513  hypothetical protein  30.51 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00777462  normal  0.634393 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45413  predicted protein  27.22 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000791095  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2397  hypothetical protein  28.86 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2318  hypothetical protein  29.37 
 
 		 185 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1551  hypothetical protein  28.48 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147627  hitchhiker  0.00645173 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2015  hypothetical protein  27.97 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>