38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2094 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2094  regulatory protein MarR  100 
 
 		 219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4956  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2643  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0020  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.965636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4547  transcriptional regulator, MarR family  28.76 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.294634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2146  transcriptional regulator, MarR family  26.2 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  0.322548 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 151 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 150 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 158 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  22.14 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 160 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  24.06 
 
 		 144 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  23.7 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  20.59 
 
 		 158 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 158 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 158 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 158 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 157 aa  45.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  36.67 
 
 		 149 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  24 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  23.02 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 152 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 160 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2534  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 151 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 142 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  23.2 
 
 		 161 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 161 aa  42.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 146 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  21.17 
 
 		 170 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  25.24 
 
 		 159 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 165 aa  41.6  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  26.14 
 
 		 161 aa  42  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 152 aa  41.6  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>