17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2003 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2003  putative ATP-dependent helicase  100 
 
 		 662 aa  1342    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.148023  hitchhiker  0.00375343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4009  putative ATP-dependent helicase  47.02 
 
 		 677 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00213516  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3306  hypothetical protein  42.15 
 
 		 662 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000532342  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0783  hypothetical protein  40.65 
 
 		 662 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2943  putative DNA/RNA helicase  40.78 
 
 		 660 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569603  unclonable  1.9165499999999998e-31 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2162  hypothetical protein  24.89 
 
 		 710 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2231  hypothetical protein  26.53 
 
 		 702 aa  92  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0202187  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2277  hypothetical protein  25.13 
 
 		 720 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000453679  hitchhiker  0.0000445422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0097  hypothetical protein  24.57 
 
 		 719 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  24.83 
 
 		 824 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2222  hypothetical protein  23.23 
 
 		 723 aa  66.6  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.747509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1013  hypothetical protein  23.37 
 
 		 726 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0969  hypothetical protein  23.37 
 
 		 726 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  23.64 
 
 		 588 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  21.52 
 
 		 830 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  21.27 
 
 		 830 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  24.37 
 
 		 616 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>