127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1956 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
397 aa  800    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  50.38 
 
 
404 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  26.68 
 
 
407 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
403 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
406 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
389 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  27.27 
 
 
388 aa  126  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
394 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 
443 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
400 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
392 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  27.76 
 
 
420 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
390 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  29.34 
 
 
1293 aa  117  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
382 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  28.08 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  29.26 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  28.28 
 
 
814 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  24.94 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  30.14 
 
 
443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  26.07 
 
 
412 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  25.19 
 
 
783 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  27.83 
 
 
729 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  24.65 
 
 
405 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  26.85 
 
 
394 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  24.31 
 
 
392 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  29.35 
 
 
477 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
397 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  24.31 
 
 
392 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.99 
 
 
477 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  24.31 
 
 
392 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  27.54 
 
 
751 aa  103  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  25.16 
 
 
385 aa  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  30.04 
 
 
728 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  32.92 
 
 
411 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  30.04 
 
 
728 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.92 
 
 
411 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 
416 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  29.12 
 
 
741 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  25.84 
 
 
783 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  22.36 
 
 
376 aa  96.7  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.22 
 
 
427 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  29.22 
 
 
427 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
705 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 
390 aa  92.8  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  28.57 
 
 
942 aa  90.1  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  27.17 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  24.15 
 
 
1119 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  22.94 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  22.79 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  25.94 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
903 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  26.85 
 
 
754 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  25 
 
 
370 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  29.68 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.34 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  22.61 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  24.29 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  24.02 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  30.29 
 
 
726 aa  70.1  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  27.67 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  24.29 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
378 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
396 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.69 
 
 
377 aa  56.6  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
346 aa  56.6  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  23.7 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
406 aa  53.9  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 
412 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1373  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
447 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
475 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0066  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.918731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  25.33 
 
 
569 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  22.44 
 
 
380 aa  50.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
414 aa  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  30.33 
 
 
394 aa  49.7  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  26 
 
 
385 aa  49.7  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  24.14 
 
 
603 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  28.02 
 
 
723 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
421 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1721  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
402 aa  47.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
353 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3251  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  26.36 
 
 
557 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>