More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1950 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  100 
 
 		 1179 aa  2415    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.83 
 
 		 1016 aa  877    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.29 
 
 		 1309 aa  639    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  58.5 
 
 		 1203 aa  629  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.31 
 
 		 1287 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.96 
 
 		 778 aa  545  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.3 
 
 		 887 aa  457  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.8 
 
 		 916 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 		 1202 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3604  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 		 1172 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 1582 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  33.62 
 
 		 1135 aa  400  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 1236 aa  391  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 1369 aa  389  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.54 
 
 		 1611 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 833 aa  382  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 		 1548 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 		 1326 aa  382  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 1234 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1230 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  33 
 
 		 1200 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 		 1238 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 812 aa  379  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 		 1238 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 1767 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.47 
 
 		 1763 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 		 1622 aa  378  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 		 1238 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 		 929 aa  376  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  33.45 
 
 		 1188 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 1238 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 1236 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 		 1767 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 1236 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 		 1267 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 1234 aa  376  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 1236 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  36.98 
 
 		 1765 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.46 
 
 		 2213 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 		 1165 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1118 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 		 1765 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 1767 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 		 1768 aa  369  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 		 1363 aa  369  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 		 1426 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  37.65 
 
 		 1177 aa  367  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  37.5 
 
 		 1683 aa  366  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 		 816 aa  366  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 		 1245 aa  365  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 1771 aa  364  5.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 		 1245 aa  364  6e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 		 1284 aa  363  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 		 1643 aa  362  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 		 1310 aa  362  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 1128 aa  362  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 		 921 aa  360  8e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  29.41 
 
 		 1418 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  31.82 
 
 		 1236 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  34.09 
 
 		 1014 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 		 2654 aa  357  5e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 1333 aa  358  5e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  37.83 
 
 		 2035 aa  357  5.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1784 aa  357  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  39.18 
 
 		 847 aa  356  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.17 
 
 		 1233 aa  356  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  28.19 
 
 		 1626 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 		 1245 aa  355  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.09 
 
 		 923 aa  354  5e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 1397 aa  353  8e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.3 
 
 		 1792 aa  353  8e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  41 
 
 		 1442 aa  353  8e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  32.86 
 
 		 1417 aa  353  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 1782 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 		 1131 aa  351  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  35.99 
 
 		 977 aa  351  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 		 1786 aa  350  6e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 		 1033 aa  350  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 		 1659 aa  349  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 1069 aa  349  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  40.61 
 
 		 1407 aa  349  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 		 1072 aa  347  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.54 
 
 		 682 aa  347  7e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 		 950 aa  346  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 925 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 		 770 aa  345  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 1126 aa  344  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 1009 aa  343  9e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 1398 aa  343  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 		 1550 aa  342  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 		 977 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.72 
 
 		 1331 aa  341  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 957 aa  341  5.9999999999999996e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.37 
 
 		 1468 aa  340  8e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 1266 aa  340  9e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  37.18 
 
 		 1346 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 		 1040 aa  339  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 758 aa  340  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.6 
 
 		 1629 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.39 
 
 		 852 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>