44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1930 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1930  hypothetical protein  100 
 
 		 595 aa  1206    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  0.0291599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4789  hypothetical protein  42.71 
 
 		 587 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0838792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5660  hypothetical protein  40.03 
 
 		 588 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3939  hypothetical protein  36.04 
 
 		 649 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462657  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2373  hypothetical protein  30 
 
 		 619 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.651768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2831  hypothetical protein  27.22 
 
 		 605 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3567  hypothetical protein  27.41 
 
 		 575 aa  176  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.336155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3564  hypothetical protein  26.45 
 
 		 572 aa  163  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1935  hypothetical protein  38.64 
 
 		 386 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.98 
 
 		 735 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5664  hypothetical protein  36.4 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0874  ICE-like protease  28.57 
 
 		 360 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00749471  normal  0.127131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.43 
 
 		 708 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.98 
 
 		 704 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.15 
 
 		 704 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 875 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 1138 aa  60.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1146 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 1144 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1103 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1139 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1102 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  23.5 
 
 		 1205 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0074  hypothetical protein  31.85 
 
 		 165 aa  53.9  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000360926  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  24.76 
 
 		 1096 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1176 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1108 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 1165 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1119 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1142 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 1179 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 1142 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1097 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 1189 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1202 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 1090 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0478  hypothetical protein  31.25 
 
 		 262 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.438425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  23.61 
 
 		 1139 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1113 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 1164 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  19.71 
 
 		 1116 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 1094 aa  43.9  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1153 aa  43.9  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  23.78 
 
 		 1154 aa  43.9  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>