More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1927 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 390 aa  788    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  29.27 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 496 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  27.48 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  26.56 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  28.11 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 397 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  24.4 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  26.56 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 383 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  27.25 
 
 		 383 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  25.8 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 384 aa  112  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  25.92 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  24.27 
 
 		 381 aa  110  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 780 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 384 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  24.55 
 
 		 386 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  24.39 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  23.85 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  23.01 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.27 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  21.28 
 
 		 395 aa  96.7  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  26.1 
 
 		 395 aa  96.3  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  25.33 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  25.16 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  22.16 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  23.12 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  24.24 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 429 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 430 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  24.58 
 
 		 377 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 429 aa  92.8  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  22.51 
 
 		 369 aa  90.1  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  28.35 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  26.22 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 430 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  22.64 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  25.14 
 
 		 435 aa  86.3  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  22.31 
 
 		 366 aa  86.3  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  26.54 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  25.25 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.87 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  25.97 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  21.96 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  24.01 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  22.75 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  21.98 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  24.93 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  21.59 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  22.29 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  22.1 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  25.29 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  21.08 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  22.77 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  24.05 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  20.7 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  22.73 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  23.53 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  22.99 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  24.12 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  21.49 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  24.04 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  24.84 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  22.41 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  23.58 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  23.02 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>