More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1908 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  100 
 
 		 66 aa  132  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  68.75 
 
 		 64 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 65 aa  83.6  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 64 aa  78.2  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  58.06 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 64 aa  77  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  53.03 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  51.56 
 
 		 64 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  53.23 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  53.23 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  57.14 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  55.38 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  53.23 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  51.56 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0994  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00825  ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0767  ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  59.26 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 63 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1579  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0493  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>