More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1881 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 203 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  49.51 
 
 		 219 aa  217  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5140  Phosphoglycerate mutase  47.52 
 
 		 214 aa  201  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  45.5 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  38.61 
 
 		 221 aa  151  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.55 
 
 		 442 aa  90.5  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 217 aa  88.6  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 202 aa  85.9  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.05 
 
 		 444 aa  85.5  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 209 aa  85.1  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 212 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 212 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  32.98 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.52 
 
 		 442 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.37 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.47 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.99 
 
 		 442 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  32.8 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.55 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.55 
 
 		 442 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.71 
 
 		 442 aa  75.9  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.95 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.2 
 
 		 547 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  28.57 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  28.57 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  29.47 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  29.95 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  29.95 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  29.95 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.73 
 
 		 443 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 233 aa  72  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 447 aa  71.6  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  30.58 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  29.47 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  31.35 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  29.85 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  26.96 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  29.27 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  33.92 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  28.23 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1617  Phosphoglycerate mutase  28.36 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194146  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  25.51 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  25.51 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  28.23 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  28 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34127  putative phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.375403 
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  23.38 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  28.86 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  26.37 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>