More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1851 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  100 
 
 		 475 aa  958    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  75.27 
 
 		 475 aa  721    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  52.97 
 
 		 470 aa  488  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  46.98 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  49.35 
 
 		 461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  43.66 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  40.75 
 
 		 468 aa  327  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  31.54 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  31 
 
 		 475 aa  186  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  29.14 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 486 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  29.45 
 
 		 463 aa  159  9e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 458 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 481 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 498 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.25 
 
 		 460 aa  147  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 505 aa  146  9e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 525 aa  146  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  23.77 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  28.43 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 469 aa  143  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 455 aa  143  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 462 aa  142  9e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 538 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 455 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 467 aa  139  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.24 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 467 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 554 aa  136  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  23.26 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 459 aa  131  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  23.89 
 
 		 518 aa  130  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  23.41 
 
 		 469 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 455 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  24.25 
 
 		 460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 462 aa  127  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.89 
 
 		 453 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  29.38 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 460 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  25.43 
 
 		 496 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  24.4 
 
 		 460 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  29.61 
 
 		 437 aa  124  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 466 aa  123  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  23.97 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  24.52 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 447 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 450 aa  120  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  24.47 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  25.19 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 448 aa  117  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 449 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  22.32 
 
 		 469 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  22.32 
 
 		 469 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 447 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  22.95 
 
 		 469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  25 
 
 		 485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  23.42 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  23.18 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  21.87 
 
 		 469 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  21.87 
 
 		 469 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  21.87 
 
 		 469 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>