20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1826 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1826  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  303  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000267645  decreased coverage  0.0000000000616753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0919  hypothetical protein  85.33 
 
 
193 aa  260  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0994011  hitchhiker  0.0000000890175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2864  hypothetical protein  84.77 
 
 
195 aa  258  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1088  hypothetical protein  84.77 
 
 
195 aa  235  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000961517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2009  hypothetical protein  84 
 
 
193 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471756  hitchhiker  0.00189164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1654  hypothetical protein  53.54 
 
 
162 aa  144  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5372  hypothetical protein  39.73 
 
 
148 aa  120  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1806  hypothetical protein  45.6 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.897355  hitchhiker  0.0000000117053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1033  hypothetical protein  41.67 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46402  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3560  hypothetical protein  43.85 
 
 
507 aa  113  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3038  hypothetical protein  46.77 
 
 
503 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4377  hypothetical protein  46.83 
 
 
492 aa  111  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3169  hypothetical protein  42.66 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.744186  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0910  hypothetical protein  39.02 
 
 
151 aa  101  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.278995  hitchhiker  0.00000644776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2270  hypothetical protein  41.18 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5558  hypothetical protein  38.58 
 
 
142 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3811  hypothetical protein  37.4 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4691  hypothetical protein  38.76 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.306809  hitchhiker  0.00137865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6669  hypothetical protein  33.64 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2541  hypothetical protein  32.11 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>