More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1810 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1810  PAS sensor protein  100 
 
 
829 aa  1705    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1701  PAS sensor protein  28.42 
 
 
975 aa  307  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454558  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3913  PAS sensor protein  35.62 
 
 
1337 aa  232  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.290527  normal  0.28306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
1060 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.51 
 
 
1759 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4249  ATP-binding region ATPase domain protein  40.17 
 
 
374 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
709 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3730  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.48 
 
 
978 aa  181  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208606  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.26 
 
 
1478 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
1339 aa  170  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
965 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  34.95 
 
 
931 aa  167  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.19 
 
 
1207 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 
1267 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  35.04 
 
 
713 aa  162  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4479  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.51 
 
 
502 aa  162  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
938 aa  161  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.69 
 
 
922 aa  160  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
640 aa  160  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2878  PAS sensor protein  30.99 
 
 
372 aa  160  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  34.98 
 
 
1629 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4322  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.13 
 
 
969 aa  159  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 
1255 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.44 
 
 
1274 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 
502 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 
1501 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.57 
 
 
865 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
1291 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  25.4 
 
 
1384 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
1026 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.27 
 
 
901 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135172  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.53 
 
 
1330 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2114  ATP-binding region ATPase domain protein  34.02 
 
 
400 aa  149  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  24.71 
 
 
1763 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.75 
 
 
1120 aa  147  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.87 
 
 
1157 aa  147  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
1118 aa  146  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  26.04 
 
 
685 aa  146  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 
1238 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 
1238 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
701 aa  144  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 
1238 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 
1238 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 
530 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.6 
 
 
1125 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  26.6 
 
 
1125 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.55 
 
 
1124 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.35 
 
 
933 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
584 aa  142  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
584 aa  142  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 
1234 aa  142  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.86 
 
 
1361 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
634 aa  140  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 
1433 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0305  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
754 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  30.19 
 
 
537 aa  139  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1072  histidine kinase  34.96 
 
 
354 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2823  histidine kinase  36.32 
 
 
501 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0331  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
929 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.590564 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.72 
 
 
1611 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 
1236 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.74 
 
 
969 aa  139  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
489 aa  138  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
584 aa  138  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.86 
 
 
1808 aa  138  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
412 aa  138  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3823  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.85 
 
 
498 aa  137  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
587 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
600 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 
1578 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 
789 aa  137  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  34.39 
 
 
527 aa  137  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1282  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 
548 aa  137  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.153514  normal  0.0403413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 
549 aa  137  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 
1236 aa  137  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
1043 aa  137  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
815 aa  137  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 
1236 aa  137  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
612 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  31.94 
 
 
591 aa  137  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.15 
 
 
1070 aa  137  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
969 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
944 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 
1234 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 
384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  31.51 
 
 
510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
640 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
885 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 
1236 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  23.9 
 
 
1535 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 
1230 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
503 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.17 
 
 
1297 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
597 aa  135  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0290  histidine kinase  35.84 
 
 
333 aa  135  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
1068 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
973 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 
1245 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>