131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1704 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 259 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.21 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  28.7 
 
 		 300 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.09 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.71 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.41 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.07 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.38 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  31.14 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.64 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  25.1 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.19 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.29 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.61 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.17 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.32 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.12 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.29 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  22.95 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.35 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  25.48 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.39 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  24.33 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  25.48 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2610  chlorinating enzyme  24.12 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0249054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.57 
 
 		 372 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.05 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.17 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.2 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  32.61 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.45 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.07 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.32 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  25.4 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.3 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  30.52 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  23.9 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.27 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.74 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  26.01 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  23.64 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  23.26 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  23.26 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  23.26 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.97 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  25.78 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  22.98 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.35 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  24.42 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.42 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.42 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  24.03 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.71 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  23.36 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  26.21 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.7 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.41 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  22.49 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.83 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.92 
 
 		 306 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2589  chlorinating enzyme  22.22 
 
 		 332 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.33 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.92 
 
 		 306 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  26.92 
 
 		 306 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.79 
 
 		 263 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  22.69 
 
 		 263 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.79 
 
 		 263 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  26.92 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.73 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.78 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  27.93 
 
 		 281 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  21.1 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  26.92 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  26.92 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  26.92 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  26.92 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  22.87 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  23.53 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.34 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  28.3 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.14 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.12 
 
 		 282 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.34 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.24 
 
 		 282 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.24 
 
 		 282 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  20.89 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5697  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.14 
 
 		 305 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.69 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  21.63 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  21.65 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.24 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29381  predicted protein  26.74 
 
 		 329 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575053  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  22.48 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  26.22 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.34 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.89 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.73 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.94 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>