249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1644 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 378 aa  778    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  59.67 
 
 		 374 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  55.68 
 
 		 375 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  53.64 
 
 		 375 aa  411  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  48.47 
 
 		 374 aa  335  7.999999999999999e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  36.63 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  38.15 
 
 		 379 aa  239  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 365 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.54 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  26.37 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 443 aa  96.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 398 aa  86.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.47 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  23.55 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  23.69 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  21.5 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0420  hypothetical protein  23.67 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  23.37 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  22.22 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  22.19 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0255  FAD dependent oxidoreductase  23.16 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  24.6 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  24.08 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3634  putative electron transfer oxidoreductase  24.76 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  21.41 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  25.68 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  26.21 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  21.55 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  22.26 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  21.45 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  20.91 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  22.22 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  22.75 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  24.09 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  22.54 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  21.73 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  22.74 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  22.19 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  22.31 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  23.16 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  22.77 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  22.41 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  22.06 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  23.05 
 
 		 426 aa  62.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  23.82 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  21.43 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.3 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  24.01 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  23.92 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  23.21 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  21.43 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  23.95 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  24.75 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  24.61 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  23.47 
 
 		 409 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  21.29 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  23.4 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  23.08 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  20.05 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  21.02 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  22.64 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  22.59 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1188  monooxygenase, FAD-binding  25.36 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  22.22 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  21.16 
 
 		 584 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  23.36 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  21.1 
 
 		 449 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  22.45 
 
 		 431 aa  57  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  20.78 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  20.54 
 
 		 455 aa  57  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  24.83 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  23.59 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  23.37 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  22.36 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  24.37 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  23.64 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  21.54 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  22.29 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  23.5 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  23.8 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  20.24 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  20.68 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  22.12 
 
 		 461 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  23.91 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3505  ubiquinone biosynthesis hydroxylase family protein  23.6 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682959  normal  0.0129679 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  23.56 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  24.23 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  25.61 
 
 		 369 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  22.39 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  22.87 
 
 		 340 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  24.73 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  23.94 
 
 		 398 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  20.23 
 
 		 391 aa  53.1  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>