228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1634 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1634  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
163 aa  327  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0454282 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2278  putative nucleotide-binding protein  59.26 
 
 
162 aa  184  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  53.99 
 
 
163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6212  protein of unknown function DUF520  53.37 
 
 
163 aa  170  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  51.85 
 
 
161 aa  160  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 
163 aa  160  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 
163 aa  159  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  50.92 
 
 
161 aa  157  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  51.23 
 
 
161 aa  157  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  51.53 
 
 
161 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
163 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  155  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  51.85 
 
 
161 aa  153  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
161 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 
161 aa  147  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 
161 aa  147  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1126  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
163 aa  141  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
163 aa  140  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
163 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
163 aa  140  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
163 aa  140  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
163 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
163 aa  140  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
163 aa  140  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
165 aa  140  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1099  hypothetical protein  41.36 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  41.1 
 
 
161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  48.12 
 
 
163 aa  137  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  41.1 
 
 
161 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  41.1 
 
 
161 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1318  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
163 aa  136  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 
163 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  44.17 
 
 
159 aa  133  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
163 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  42.94 
 
 
163 aa  131  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
163 aa  131  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
163 aa  131  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  42.5 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0688  putative nucleotide-binding protein  41.1 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.067831  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  39.88 
 
 
161 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 
161 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  39.88 
 
 
163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  39.26 
 
 
161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  38.04 
 
 
163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 
159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 
159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  42.94 
 
 
159 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
166 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  39.88 
 
 
161 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  44.72 
 
 
165 aa  127  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000772661  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  39.26 
 
 
161 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  39.26 
 
 
161 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  42.94 
 
 
159 aa  127  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  45 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  39.26 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  39.26 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  39.26 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  38.65 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  39.26 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  39.26 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  39.26 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  40.49 
 
 
162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  39.26 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  38.65 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  39.26 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  38.65 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  39.26 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  39.26 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 
161 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  39.88 
 
 
163 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  39.88 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  39.88 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  39.88 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  39.88 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  40.62 
 
 
165 aa  124  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
163 aa  124  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  38.04 
 
 
163 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  40.37 
 
 
164 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  41.1 
 
 
162 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1728  putative nucleotide-binding protein  41.1 
 
 
160 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.499513  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0770  putative nucleotide-binding protein  39.26 
 
 
161 aa  122  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000279998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
164 aa  122  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  41.1 
 
 
161 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3443  putative nucleotide-binding protein  40.49 
 
 
161 aa  122  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000233798  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  41.25 
 
 
164 aa  121  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3114  putative nucleotide-binding protein  40.49 
 
 
161 aa  121  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  40.49 
 
 
162 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 
162 aa  120  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0732  putative nucleotide-binding protein  40.49 
 
 
161 aa  120  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
164 aa  120  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 
162 aa  120  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1706  putative nucleotide-binding protein  43.9 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.280602  hitchhiker  0.00217335 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  37.65 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>