More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1593 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  100 
 
 
611 aa  1261    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  40.8 
 
 
616 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  28.15 
 
 
423 aa  136  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  27.81 
 
 
963 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  26.36 
 
 
653 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  30.55 
 
 
445 aa  128  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  26.63 
 
 
687 aa  127  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 
652 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  33.49 
 
 
475 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  26.88 
 
 
415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 
774 aa  121  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  31.72 
 
 
432 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  29.54 
 
 
463 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  26.29 
 
 
431 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  29.67 
 
 
484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 
795 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  32.5 
 
 
352 aa  110  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  28.39 
 
 
1454 aa  110  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  32 
 
 
371 aa  103  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  30.86 
 
 
371 aa  97.1  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  32 
 
 
371 aa  96.7  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  26.81 
 
 
1682 aa  94.7  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  21.87 
 
 
606 aa  94  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  26.84 
 
 
2122 aa  93.2  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  27.27 
 
 
324 aa  92.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  26.18 
 
 
322 aa  91.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  27.89 
 
 
1812 aa  92  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  23.13 
 
 
396 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  25.19 
 
 
457 aa  87.4  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  26.62 
 
 
322 aa  87.4  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.24 
 
 
385 aa  87  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2854  metallophosphoesterase  29.68 
 
 
382 aa  87  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.806939  decreased coverage  0.00466142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  25.6 
 
 
439 aa  87  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  26.54 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  21.97 
 
 
475 aa  85.5  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  26.91 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  26.91 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.81 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.49 
 
 
392 aa  84  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  24.93 
 
 
469 aa  84  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  29.65 
 
 
901 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.1 
 
 
392 aa  83.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  27.6 
 
 
450 aa  83.2  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.8 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.56 
 
 
392 aa  82.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  23.8 
 
 
392 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.8 
 
 
392 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.8 
 
 
392 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  31.34 
 
 
440 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  23.8 
 
 
392 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.19 
 
 
392 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.19 
 
 
392 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.8 
 
 
392 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.19 
 
 
392 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.49 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.15 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.02 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.49 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  29.94 
 
 
445 aa  79.7  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  29.15 
 
 
455 aa  80.1  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  26.73 
 
 
422 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  27.55 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  25.73 
 
 
514 aa  78.2  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  27.24 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  23.51 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  23.72 
 
 
363 aa  77  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.89 
 
 
415 aa  77  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  25 
 
 
384 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  24.66 
 
 
384 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  27.94 
 
 
365 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.15 
 
 
393 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  25.17 
 
 
1328 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  24.04 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0137  Pyrrolo-quinoline quinone  26.61 
 
 
481 aa  76.3  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.17 
 
 
393 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  26.59 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.09 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  25.53 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 
611 aa  75.1  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3619  Pyrrolo-quinoline quinone  30.85 
 
 
581 aa  75.1  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.23 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.01 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  25.17 
 
 
1241 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.25 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  25.57 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000513554  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1359  Pyrrolo-quinoline quinone  25.85 
 
 
377 aa  72  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000339921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1325  metallophosphoesterase  29.35 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  24.02 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.02 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.1 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  21.47 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.67 
 
 
1383 aa  70.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  35.88 
 
 
546 aa  71.2  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  27.36 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.43 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  22.88 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.58 
 
 
414 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  28.48 
 
 
382 aa  70.1  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  25.35 
 
 
374 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  31.45 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>