133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1576 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 273 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  58.82 
 
 		 270 aa  353  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.56 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  31.8 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.6 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.04 
 
 		 253 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.12 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.52 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.34 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.43 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.14 
 
 		 278 aa  85.5  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.81 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.54 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.5 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.22 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.53 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.58 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.58 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  26.19 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.41 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.62 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.49 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.9 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  26.95 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.54 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.27 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.14 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.37 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.14 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  24.6 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.6 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.9 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  24.6 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  22.88 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.39 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.22 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.6 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.6 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.13 
 
 		 303 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.14 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.08 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.74 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  25.63 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.79 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.36 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2489  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.65 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.53 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.18 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.67 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.58 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.2 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  29.5 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.67 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32238  predicted protein  24.81 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.194456 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.18 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.05 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.93 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.32 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.93 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  22.86 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.288196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.28 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  23.35 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2672  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.79 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.06 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.38 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.15 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.35 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.94 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.06 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.27 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  22.78 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.75 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.46 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  27.15 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  23.97 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  24.58 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  28.46 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.67 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  24.7 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4809  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.98 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00887466  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_7544  predicted protein  30.71 
 
 		 135 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35257  predicted protein  23.25 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109347  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  23.85 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  23.08 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  21.65 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  23.29 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.59 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.1 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.37 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.62 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.4 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  27.84 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>