More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1568 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  100 
 
 
254 aa  519  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  60.96 
 
 
251 aa  315  6e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  58.96 
 
 
254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  55.38 
 
 
253 aa  285  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  54.55 
 
 
251 aa  278  5e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  51 
 
 
256 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  50.59 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
250 aa  252  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
655 aa  250  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  51 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  48.37 
 
 
249 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 
251 aa  241  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
251 aa  240  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  49 
 
 
251 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  49 
 
 
251 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 
251 aa  239  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 
253 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 
251 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 
248 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 
248 aa  238  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  48.21 
 
 
254 aa  237  1e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 
248 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 
251 aa  235  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
253 aa  235  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  49.17 
 
 
243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 
250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 
252 aa  234  7e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  47.35 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  48.76 
 
 
243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  47.41 
 
 
250 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  49.21 
 
 
253 aa  232  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 
251 aa  232  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
251 aa  232  5e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.79 
 
 
646 aa  231  6e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  49 
 
 
252 aa  231  6e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 
256 aa  231  9e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 
245 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
250 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 
251 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  56.48 
 
 
243 aa  229  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 
251 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 
248 aa  228  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6209  triosephosphate isomerase  49.79 
 
 
242 aa  228  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.74008  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
251 aa  228  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
251 aa  228  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
251 aa  228  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 
251 aa  228  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 
251 aa  227  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 
251 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  46 
 
 
251 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 
250 aa  226  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
251 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  49.01 
 
 
258 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  44.96 
 
 
260 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 
249 aa  226  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
251 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
251 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 
253 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
251 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  47.22 
 
 
249 aa  226  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  44.44 
 
 
254 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 
266 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  46.03 
 
 
250 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  43.8 
 
 
260 aa  225  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 
275 aa  224  7e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  53.52 
 
 
240 aa  224  7e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 
248 aa  224  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 
260 aa  224  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 
260 aa  224  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 
260 aa  224  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 
260 aa  224  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 
260 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 
259 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 
260 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 
260 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 
260 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 
260 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 
261 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 
252 aa  223  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  44.57 
 
 
260 aa  223  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  43.8 
 
 
260 aa  222  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 
253 aa  222  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 
253 aa  222  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 
256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 
251 aa  221  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 
251 aa  221  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 
250 aa  222  6e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  42.8 
 
 
250 aa  221  9e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 
252 aa  221  9e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 
246 aa  221  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  45.42 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  47.15 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>