More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1563 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  74.38 
 
 		 405 aa  636    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  100 
 
 		 403 aa  834    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  67.66 
 
 		 417 aa  574  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  63.46 
 
 		 404 aa  542  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  62.47 
 
 		 404 aa  536  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  62.47 
 
 		 404 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  62.47 
 
 		 404 aa  534  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  62.47 
 
 		 404 aa  534  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  61.98 
 
 		 404 aa  533  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  62.47 
 
 		 404 aa  534  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  62.47 
 
 		 404 aa  534  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  61.73 
 
 		 404 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  62.47 
 
 		 404 aa  534  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  62.47 
 
 		 404 aa  534  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  62.47 
 
 		 404 aa  534  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  62.96 
 
 		 404 aa  534  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  62.47 
 
 		 404 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  61.48 
 
 		 404 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  60.99 
 
 		 404 aa  528  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  61.48 
 
 		 404 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  61.48 
 
 		 404 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  61.48 
 
 		 404 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  60.6 
 
 		 419 aa  526  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  59.85 
 
 		 419 aa  521  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  60.74 
 
 		 404 aa  523  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  61.85 
 
 		 407 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  61.85 
 
 		 407 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  61.85 
 
 		 407 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  62.09 
 
 		 407 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  61.85 
 
 		 407 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  61.85 
 
 		 407 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  61.85 
 
 		 407 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  61.29 
 
 		 407 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  61.85 
 
 		 407 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  60.6 
 
 		 405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  60.85 
 
 		 405 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  63.93 
 
 		 404 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  64.18 
 
 		 404 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  60.55 
 
 		 407 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  60.79 
 
 		 407 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  60.79 
 
 		 407 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  60.55 
 
 		 407 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  60 
 
 		 404 aa  511  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  63.68 
 
 		 404 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  59.8 
 
 		 407 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  60.6 
 
 		 406 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  60.55 
 
 		 407 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  61.1 
 
 		 407 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  60.55 
 
 		 407 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  59.01 
 
 		 404 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  60.25 
 
 		 404 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  59.75 
 
 		 404 aa  508  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  59.7 
 
 		 405 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  60.3 
 
 		 407 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  59.7 
 
 		 405 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  60.25 
 
 		 404 aa  509  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1276  cysteine desulfurase  61.69 
 
 		 409 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00157162  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  59.35 
 
 		 405 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  59.41 
 
 		 405 aa  505  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  60.1 
 
 		 407 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0435  cysteine desulfurase  61.44 
 
 		 409 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  59.75 
 
 		 404 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1168  cysteine desulfurase  61.69 
 
 		 409 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00941489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  59.51 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  61.63 
 
 		 403 aa  504  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  59.55 
 
 		 403 aa  505  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  60.1 
 
 		 421 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  59.75 
 
 		 404 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  59.75 
 
 		 404 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  59.26 
 
 		 404 aa  501  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  59.5 
 
 		 403 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  59.5 
 
 		 436 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  62.94 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  58.02 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  59.5 
 
 		 436 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1961  cysteine desulfurase  59.51 
 
 		 404 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.037165  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  59.01 
 
 		 404 aa  501  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  59.75 
 
 		 404 aa  501  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  59.51 
 
 		 404 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000240874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5192  aminotransferase class V  63.52 
 
 		 392 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.34588 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  58.27 
 
 		 404 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  59.51 
 
 		 404 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  59.6 
 
 		 405 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  58.6 
 
 		 405 aa  501  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  59.25 
 
 		 403 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  58.71 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  57.53 
 
 		 404 aa  497  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  57.53 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  58.27 
 
 		 407 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  59.26 
 
 		 404 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  58.6 
 
 		 406 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  59.25 
 
 		 408 aa  492  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  59.35 
 
 		 403 aa  490  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  58.42 
 
 		 415 aa  490  1e-137  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  57.11 
 
 		 406 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  57.36 
 
 		 406 aa  489  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  58.52 
 
 		 404 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  56.3 
 
 		 406 aa  489  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1324  cysteine desulfurase IscS  58.31 
 
 		 403 aa  488  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00549463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  57.36 
 
 		 406 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>