More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1478 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
342 aa  696    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  73.57 
 
 
333 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  73.09 
 
 
334 aa  495  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  72.17 
 
 
333 aa  489  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  69.3 
 
 
333 aa  476  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  67.47 
 
 
331 aa  472  1e-132  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.24 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  59.94 
 
 
327 aa  400  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  56.71 
 
 
325 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.73 
 
 
329 aa  381  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.04 
 
 
329 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.52 
 
 
332 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  53.64 
 
 
332 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  58.69 
 
 
330 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.71 
 
 
325 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.13 
 
 
332 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  55.02 
 
 
332 aa  367  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.24 
 
 
332 aa  366  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.74 
 
 
327 aa  367  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.94 
 
 
329 aa  366  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.78 
 
 
332 aa  364  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  53.71 
 
 
340 aa  363  3e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.31 
 
 
350 aa  362  5.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  58.2 
 
 
328 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  50.94 
 
 
345 aa  345  5e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.35 
 
 
317 aa  344  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  53.66 
 
 
328 aa  343  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.13 
 
 
329 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  54.07 
 
 
315 aa  341  1e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.21 
 
 
350 aa  341  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.58 
 
 
354 aa  339  4e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  49.38 
 
 
377 aa  339  4e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  51.76 
 
 
337 aa  338  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  49.85 
 
 
385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
378 aa  335  5e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  49.85 
 
 
390 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  49.85 
 
 
390 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  49.85 
 
 
390 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  51.44 
 
 
337 aa  335  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  50.15 
 
 
386 aa  334  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  46.65 
 
 
371 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.9 
 
 
360 aa  330  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.22 
 
 
325 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  49.69 
 
 
344 aa  328  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  53.02 
 
 
319 aa  328  8e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.9 
 
 
432 aa  328  9e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  52.56 
 
 
318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  46.36 
 
 
370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  52.4 
 
 
318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
346 aa  325  7e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  49.54 
 
 
345 aa  323  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  49.53 
 
 
324 aa  322  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  51.43 
 
 
321 aa  322  5e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  50.96 
 
 
345 aa  322  5e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  52.96 
 
 
319 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.1 
 
 
362 aa  322  7e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  50.98 
 
 
326 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  52.63 
 
 
319 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  48.71 
 
 
339 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.44 
 
 
335 aa  320  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  49.09 
 
 
323 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  52.96 
 
 
319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.51 
 
 
353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  52.96 
 
 
319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  50.98 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  52.96 
 
 
319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  50.48 
 
 
339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  51.3 
 
 
318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  51.97 
 
 
319 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  53.11 
 
 
330 aa  318  9e-86  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  52.63 
 
 
319 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.94 
 
 
336 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  49.52 
 
 
320 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  49.54 
 
 
333 aa  317  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.65 
 
 
344 aa  315  5e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  51.32 
 
 
319 aa  315  8e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  49.69 
 
 
369 aa  315  9e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.7 
 
 
396 aa  315  9e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  51.38 
 
 
326 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  52.05 
 
 
339 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  50.65 
 
 
318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  48.85 
 
 
320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  50.32 
 
 
348 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  50.64 
 
 
331 aa  313  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  50.32 
 
 
331 aa  312  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  51.31 
 
 
318 aa  312  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  49.68 
 
 
347 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  50.17 
 
 
369 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  50.65 
 
 
318 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  49.35 
 
 
318 aa  309  5e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  49.54 
 
 
335 aa  309  5.9999999999999995e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2374  ATPase  50.97 
 
 
363 aa  308  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  45.77 
 
 
334 aa  308  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  49.67 
 
 
316 aa  308  8e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.8 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  49.03 
 
 
318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  50.49 
 
 
318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  50 
 
 
318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  49.68 
 
 
318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  50.49 
 
 
318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>