21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1387 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1387  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  742    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1504  hypothetical protein  37.95 
 
 
362 aa  236  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.232931  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  28.81 
 
 
593 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2940  hypothetical protein  28.48 
 
 
368 aa  139  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224706  normal  0.459011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  30.84 
 
 
593 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3572  hypothetical protein  26.71 
 
 
368 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0629416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0963  hypothetical protein  24.15 
 
 
382 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  25.14 
 
 
358 aa  62.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0092  lipolytic protein G-D-S-L family  26.2 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  23.53 
 
 
329 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1005  hypothetical protein  26.29 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0370  hypothetical protein  24.78 
 
 
393 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  21.33 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2001  hypothetical protein  21.28 
 
 
394 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6201  hypothetical protein  23.84 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196409  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1168  hypothetical protein  21.47 
 
 
342 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  28.85 
 
 
386 aa  47.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19400  hypothetical protein  20.13 
 
 
392 aa  46.6  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2261  hypothetical protein  23.49 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2620  hypothetical protein  20.57 
 
 
413 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2781  hypothetical protein  31.43 
 
 
341 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>