More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1370 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1370  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 385 aa  800    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.67195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3768  DNA-directed DNA polymerase  51.44 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  51.5 
 
 		 404 aa  415  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4919  DNA-directed DNA polymerase  47.27 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3568  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  51.06 
 
 		 380 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  52.27 
 
 		 385 aa  403  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  38.21 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  36.88 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  35.94 
 
 		 397 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  35.81 
 
 		 386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  35.2 
 
 		 390 aa  232  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  35.53 
 
 		 391 aa  232  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  35.41 
 
 		 356 aa  232  9e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  35.51 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  35.13 
 
 		 390 aa  229  5e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  34.65 
 
 		 399 aa  229  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  34.12 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  34.95 
 
 		 412 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  35.51 
 
 		 389 aa  225  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  35.08 
 
 		 410 aa  225  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  36.05 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  36.08 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  37.09 
 
 		 395 aa  222  9e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  33.08 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  32.56 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  34.3 
 
 		 410 aa  219  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  34.97 
 
 		 374 aa  219  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  33.68 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  33.07 
 
 		 408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  35.75 
 
 		 409 aa  216  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  32.56 
 
 		 409 aa  215  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  35.57 
 
 		 359 aa  215  9e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  33.85 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  32.48 
 
 		 426 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  31.69 
 
 		 409 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  32.29 
 
 		 424 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  32.73 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  34.02 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  31.07 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  35.65 
 
 		 378 aa  210  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  34.21 
 
 		 406 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  35.65 
 
 		 378 aa  210  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.3 
 
 		 409 aa  209  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  34.76 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  32.64 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  35.31 
 
 		 481 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  34.9 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  36.15 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  33.68 
 
 		 415 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  35.17 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  33.69 
 
 		 435 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  32.39 
 
 		 419 aa  206  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  34.19 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  32.46 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  32.89 
 
 		 408 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  32.31 
 
 		 430 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  31.94 
 
 		 429 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.81 
 
 		 414 aa  202  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  30.75 
 
 		 413 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  33.73 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  33.99 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  33.9 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  33.73 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  33.73 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  34.19 
 
 		 418 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  33.15 
 
 		 466 aa  201  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  32.31 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  32.72 
 
 		 431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  33.24 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  34.31 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  33.24 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  33.24 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  34.31 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  33.24 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  33.51 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.43 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  34.6 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  33.43 
 
 		 379 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1429  DNA polymerase IV  34.12 
 
 		 429 aa  196  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.587123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  32.19 
 
 		 435 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  32.94 
 
 		 351 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  36.18 
 
 		 360 aa  196  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  34.46 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  32.23 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  33.33 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  30.45 
 
 		 407 aa  193  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  33.14 
 
 		 405 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  32.36 
 
 		 429 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3247  DNA-directed DNA polymerase  31.7 
 
 		 459 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  34.22 
 
 		 359 aa  192  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  31.12 
 
 		 834 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  32.46 
 
 		 402 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  34.19 
 
 		 364 aa  192  9e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  34.41 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  34.41 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  34.41 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  34.41 
 
 		 406 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  31.9 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  34.41 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>