More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1345 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  100 
 
 		 227 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.11 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 225 aa  227  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.9 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 223 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.67 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 266 aa  218  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  45.58 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  45.33 
 
 		 223 aa  214  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0453  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.65 
 
 		 225 aa  214  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 225 aa  214  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  46.22 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 223 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0990  transcriptional regulator  48 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166767  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2743  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.62 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.33 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.33 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.33 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  44 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3918  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 236 aa  201  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  44.44 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.56 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2944  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 223 aa  198  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  0.70587 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 225 aa  198  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  44.25 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  44.25 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  44.25 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  44.25 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  44.25 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  44.25 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  44.25 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.81 
 
 		 227 aa  194  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  44 
 
 		 238 aa  194  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  42.48 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  42.04 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.36 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  41.78 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.81 
 
 		 242 aa  192  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  41.59 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 283 aa  191  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  40.97 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0258  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.92 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4296  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.92 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000252174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0197  transcriptional activator protein, response regulator  46.19 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0086442  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0317  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0376  DNA-binding response regulator IrlR  42.04 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.083776  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 222 aa  188  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 227 aa  188  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1103  DNA-binding response regulator IrlR  42.48 
 
 		 230 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0630149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 228 aa  187  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2716  DNA-binding heavy metal response regulator  42.48 
 
 		 230 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558922  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  43.5 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.56 
 
 		 227 aa  187  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2869  transcriptional activator protein IrlR  42.48 
 
 		 230 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.354021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2215  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.59 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2735  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.089268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>