More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1271 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1271  Patatin  100 
 
 		 775 aa  1580    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  32.9 
 
 		 728 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  33.13 
 
 		 728 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  33.85 
 
 		 728 aa  171  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  32.8 
 
 		 751 aa  170  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  32.58 
 
 		 728 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  33.22 
 
 		 727 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  33.9 
 
 		 728 aa  167  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  28.4 
 
 		 760 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  35.64 
 
 		 733 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  27.34 
 
 		 720 aa  164  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  29.66 
 
 		 751 aa  160  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  27.29 
 
 		 748 aa  160  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  27.32 
 
 		 740 aa  156  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  31.91 
 
 		 894 aa  156  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  32.56 
 
 		 950 aa  156  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  29.69 
 
 		 738 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  29.02 
 
 		 923 aa  154  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  32.79 
 
 		 741 aa  154  8e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  29.26 
 
 		 735 aa  153  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  29.93 
 
 		 735 aa  152  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  30.6 
 
 		 754 aa  152  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  30.38 
 
 		 738 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  29.19 
 
 		 739 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  29.61 
 
 		 738 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  29.54 
 
 		 738 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  29.54 
 
 		 738 aa  149  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  26.29 
 
 		 740 aa  147  6e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  29.31 
 
 		 738 aa  147  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  29.31 
 
 		 738 aa  147  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  30.92 
 
 		 875 aa  146  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  27.03 
 
 		 746 aa  147  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  29.91 
 
 		 737 aa  146  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  29.39 
 
 		 737 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  29.81 
 
 		 736 aa  146  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  24.13 
 
 		 767 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  31.23 
 
 		 900 aa  145  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  31.54 
 
 		 777 aa  145  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  28.52 
 
 		 734 aa  145  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  29.79 
 
 		 790 aa  137  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  26.33 
 
 		 733 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  27.62 
 
 		 753 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  32.66 
 
 		 750 aa  135  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  29.38 
 
 		 909 aa  134  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  27.52 
 
 		 981 aa  134  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  28.38 
 
 		 737 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  28.16 
 
 		 745 aa  127  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  27.8 
 
 		 256 aa  126  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  26.18 
 
 		 745 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  28.81 
 
 		 667 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  33.45 
 
 		 771 aa  121  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  23.98 
 
 		 707 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  26.8 
 
 		 333 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  31.21 
 
 		 798 aa  121  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  26.8 
 
 		 320 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  31.21 
 
 		 796 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  32.2 
 
 		 804 aa  120  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  26.8 
 
 		 320 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  30.58 
 
 		 945 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  30.58 
 
 		 933 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  30.58 
 
 		 920 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  24.5 
 
 		 813 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  30.58 
 
 		 728 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  30.58 
 
 		 852 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  30.58 
 
 		 930 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  31.86 
 
 		 776 aa  119  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  31.22 
 
 		 803 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  29.45 
 
 		 305 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  31.22 
 
 		 803 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  29.45 
 
 		 305 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  31.22 
 
 		 803 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  29.45 
 
 		 306 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  28.77 
 
 		 474 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  29.11 
 
 		 308 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  28.77 
 
 		 302 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  28.77 
 
 		 306 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  28.77 
 
 		 347 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  28.81 
 
 		 347 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  28.77 
 
 		 347 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  26.25 
 
 		 311 aa  115  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  27.74 
 
 		 358 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  26.44 
 
 		 272 aa  114  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  28.42 
 
 		 302 aa  114  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  29.82 
 
 		 714 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  29.11 
 
 		 349 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  25.98 
 
 		 250 aa  112  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  29.68 
 
 		 764 aa  111  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  26.3 
 
 		 316 aa  110  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  28.21 
 
 		 263 aa  110  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  26.69 
 
 		 320 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  25.23 
 
 		 310 aa  110  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  26.24 
 
 		 267 aa  110  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  27.08 
 
 		 259 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  26.69 
 
 		 260 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  26.71 
 
 		 346 aa  107  9e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  27.8 
 
 		 293 aa  107  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  26.71 
 
 		 346 aa  107  9e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  29.15 
 
 		 275 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  30.84 
 
 		 315 aa  106  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  32.42 
 
 		 263 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>