More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1240 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
290 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.08 
 
 
294 aa  414  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.36 
 
 
312 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.76 
 
 
290 aa  298  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  29.68 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  28.99 
 
 
309 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  26.6 
 
 
312 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  26.9 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  25.36 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 
367 aa  92  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  24.41 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  24.57 
 
 
305 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  26.28 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  27.05 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  23.39 
 
 
305 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  23.99 
 
 
305 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  24.41 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  24.41 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  24.41 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  24.15 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  22.79 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3635  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.85 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.6 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.21 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 
310 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.99 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  25.52 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.79 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  26.28 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.11 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  25.36 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  25.36 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  26.35 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.55 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2567  hypothetical protein  27.44 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.8 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  26.42 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  30.59 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  27.64 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  24.29 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  24.29 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  24.29 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  24.29 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  29.86 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  23.93 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  27.11 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1245  putative permease  25.75 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  26.91 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  27.34 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  24.75 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.25 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  25.42 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25.08 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.93 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.93 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  25.42 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  22.61 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  25.09 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  24.52 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  22.22 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  22.61 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  24.74 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 
286 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.61 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  24.91 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  25.26 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  23.91 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  25 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.78 
 
 
315 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  26.13 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  24.67 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  24.38 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.62 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.34 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  30.29 
 
 
364 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  22.97 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  24.81 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  25.28 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  24.04 
 
 
289 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.65 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  32 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0398  EamA family protein  24.07 
 
 
316 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0389  DMT family permease  24.07 
 
 
316 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  26.16 
 
 
302 aa  62.8  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  25.17 
 
 
296 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0411  eama family protein  24.07 
 
 
316 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0456  transporter, EamA family  24.07 
 
 
316 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
310 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  22.79 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  23.31 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>