283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1215 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
157 aa  328  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  65.81 
 
 
155 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  54.97 
 
 
150 aa  177  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  55.26 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  59.09 
 
 
153 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  53.38 
 
 
162 aa  167  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.03 
 
 
146 aa  167  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.37 
 
 
163 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.95 
 
 
152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.86 
 
 
163 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.22 
 
 
163 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.59 
 
 
145 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  49.65 
 
 
145 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.21 
 
 
145 aa  153  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  48.94 
 
 
145 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.9 
 
 
151 aa  152  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.9 
 
 
145 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  46.9 
 
 
149 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.21 
 
 
145 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  48.94 
 
 
145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  46.85 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.9 
 
 
145 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  49.65 
 
 
145 aa  150  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  48.94 
 
 
145 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.37 
 
 
155 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.63 
 
 
159 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.23 
 
 
145 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
154 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  48.23 
 
 
145 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.23 
 
 
145 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.28 
 
 
145 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  46.21 
 
 
145 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.83 
 
 
145 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.1 
 
 
146 aa  147  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  51.05 
 
 
155 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  45.28 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.26 
 
 
159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  45.28 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  47.95 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  44.9 
 
 
157 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.05 
 
 
153 aa  145  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  48.95 
 
 
151 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  49.32 
 
 
159 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.63 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.26 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.89 
 
 
159 aa  144  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.63 
 
 
159 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  48.63 
 
 
159 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  47.55 
 
 
151 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  47.89 
 
 
151 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  44.83 
 
 
151 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  47.55 
 
 
151 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
153 aa  142  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.98 
 
 
152 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  47.89 
 
 
149 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  46 
 
 
159 aa  140  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.89 
 
 
151 aa  140  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.55 
 
 
145 aa  140  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.21 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  45.71 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  45.71 
 
 
167 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  47.83 
 
 
152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.52 
 
 
159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.68 
 
 
152 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  47.22 
 
 
158 aa  133  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.71 
 
 
156 aa  133  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  43.06 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.1 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  45 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  41.78 
 
 
159 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
145 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  42.86 
 
 
145 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.39 
 
 
152 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  42.36 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.06 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  42.14 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.77 
 
 
153 aa  128  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.58 
 
 
159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  51.28 
 
 
144 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  51.28 
 
 
144 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  43.57 
 
 
156 aa  127  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  44.53 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  43.57 
 
 
147 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.16 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.18 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  41.78 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.14 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3104  alkylhydroperoxidase  43.97 
 
 
149 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207419  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  43.28 
 
 
157 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.14 
 
 
153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.62 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  45.52 
 
 
157 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  56.86 
 
 
129 aa  124  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2902  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.57 
 
 
148 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  50.43 
 
 
144 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  50.43 
 
 
144 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  45.52 
 
 
157 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>