More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1185 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1185  response regulator receiver  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1620  two component transcriptional regulator  60.27 
 
 		 228 aa  277  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2454  transcriptional regulator domain protein  53.36 
 
 		 224 aa  235  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.02572  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4882  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2586  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2540  response regulator receiver  40.79 
 
 		 231 aa  171  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 229 aa  169  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1332  response regulator receiver  38.84 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3534  two-component system response regulator  38.12 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2732  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4933  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 224 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.742602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0465  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  36.24 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  36.24 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  37.05 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  39.37 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.61 
 
 		 220 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.61 
 
 		 220 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.61 
 
 		 220 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  37.22 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.65 
 
 		 224 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.541096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  39.82 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.91 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1449  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  37.1 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  37.1 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  37.1 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  37.22 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.22 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0708  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.56 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328024  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5331  transcriptional regulator two components regulatory system  37.55 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  37.1 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  36.65 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 235 aa  155  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56950  putative two-component response regulator  37.22 
 
 		 227 aa  154  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3374  heavy metal response regulator  39.19 
 
 		 229 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 226 aa  154  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  37.56 
 
 		 221 aa  154  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.65 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3603  DNA-binding heavy metal response regulator  39.19 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203952  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  38.39 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4952  putative two-component response regulator  37.22 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.39 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  37.95 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.56 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  39.56 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.56 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.1 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.1 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.1 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2480  DNA-binding heavy metal response regulator  36.32 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000187636  normal  0.518539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.1 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0819  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1034  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.171933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.01 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6964  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.2 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.043471  normal  0.107802 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  36.77 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.32 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  35.4 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  36.32 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4498  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000234919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 265 aa  151  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.77 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00315  probable two component response regulator transcription regulator protein  36.61 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 233 aa  151  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.67 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 231 aa  151  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.22 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6173  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.65 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 220 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0353  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1189  response regulator  35.71 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>