More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1132 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  43.28 
 
 		 857 aa  689    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  43.28 
 
 		 857 aa  689    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0559  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  48.59 
 
 		 870 aa  776    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  48.57 
 
 		 824 aa  776    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  45.53 
 
 		 812 aa  728    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  42.68 
 
 		 865 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0010  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  51.45 
 
 		 859 aa  877    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169656 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2036  AAA family ATPase  44.43 
 
 		 832 aa  732    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  49.64 
 
 		 817 aa  820    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1335  ATP-dependent protease  43.15 
 
 		 862 aa  670    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.255547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  51.82 
 
 		 811 aa  833    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  44.58 
 
 		 861 aa  708    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  42.47 
 
 		 874 aa  675    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3577  clpB protein  42.95 
 
 		 857 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  51.82 
 
 		 811 aa  833    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  51.82 
 
 		 811 aa  833    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  51.82 
 
 		 811 aa  833    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1377  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.1 
 
 		 865 aa  677    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  42.78 
 
 		 858 aa  690    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  42.78 
 
 		 858 aa  691    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  43.23 
 
 		 863 aa  676    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  48.12 
 
 		 830 aa  801    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  46.81 
 
 		 855 aa  795    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  41.17 
 
 		 891 aa  669    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  48.67 
 
 		 823 aa  815    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  43 
 
 		 872 aa  697    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  48 
 
 		 814 aa  773    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2389  ClpB heat-shock protein  43.39 
 
 		 865 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5148  AAA ATPase, ClpB  42.94 
 
 		 865 aa  670    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.830586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  67.37 
 
 		 847 aa  1150    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  47.36 
 
 		 843 aa  793    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1484  ATPase  64.4 
 
 		 863 aa  1040    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  47.71 
 
 		 846 aa  805    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2851  AAA ATPase  43.2 
 
 		 864 aa  674    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000473406  hitchhiker  0.00000000124432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  51.82 
 
 		 811 aa  833    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  47.99 
 
 		 842 aa  796    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  48.55 
 
 		 824 aa  803    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  43.13 
 
 		 883 aa  696    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  50.12 
 
 		 840 aa  785    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2205  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.38 
 
 		 865 aa  679    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  42.7 
 
 		 870 aa  671    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  48 
 
 		 834 aa  792    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  40.59 
 
 		 879 aa  669    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2824  AAA ATPase, central region  41.38 
 
 		 859 aa  672    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.553525  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0119  ClpB protein  40.65 
 
 		 854 aa  667    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3987  ATPase AAA-2  40.97 
 
 		 871 aa  667    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598394  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2198  ATPase AAA-2  43.64 
 
 		 861 aa  681    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.105301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  43.04 
 
 		 865 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2861  ATPase AAA-2  43.41 
 
 		 862 aa  677    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.133285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3573  ATPase AAA-2  45.88 
 
 		 818 aa  723    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  42.26 
 
 		 859 aa  683    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6232  ATPase AAA-2  43.17 
 
 		 865 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  48.17 
 
 		 847 aa  766    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  46.25 
 
 		 837 aa  705    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  45.38 
 
 		 886 aa  700    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  46.79 
 
 		 834 aa  781    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1337  ATPase AAA-2  43.2 
 
 		 858 aa  678    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  42.69 
 
 		 891 aa  676    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1079  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  70.3 
 
 		 848 aa  1221    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  48.89 
 
 		 814 aa  771    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  48.77 
 
 		 814 aa  766    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  48.76 
 
 		 825 aa  811    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  48.06 
 
 		 825 aa  787    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2991  ATPase  43.31 
 
 		 857 aa  673    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00302942  normal  0.61786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3072  ATPase  43.31 
 
 		 857 aa  673    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2558  ATPase  41.88 
 
 		 864 aa  671    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111038  hitchhiker  0.00562869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0669  ATPase  42.55 
 
 		 865 aa  669    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0949399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  50.18 
 
 		 828 aa  839    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1785  ATPase  43.05 
 
 		 865 aa  673    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60190  clpB protein  41.93 
 
 		 854 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00250267  hitchhiker  0.00000000231015 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0666  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  44.71 
 
 		 816 aa  683    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.483496  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0514  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  44.59 
 
 		 823 aa  744    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.262133  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0283  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  46.04 
 
 		 838 aa  703    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.114568  hitchhiker  0.0000140649 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0185  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  45.39 
 
 		 826 aa  708    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  48.37 
 
 		 830 aa  798    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1847  ATPase  43.17 
 
 		 865 aa  675    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3169  ATPase  43.31 
 
 		 857 aa  673    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00027679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  49.27 
 
 		 839 aa  814    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1737  ATPase  42.86 
 
 		 873 aa  685    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  66.75 
 
 		 854 aa  1145    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  41.98 
 
 		 875 aa  677    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  47.94 
 
 		 861 aa  787    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2603  clpB protein  42.78 
 
 		 857 aa  674    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0399134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  48.17 
 
 		 847 aa  766    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3263  chaperone ClpB  43.17 
 
 		 857 aa  669    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  47.68 
 
 		 847 aa  775    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1867  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.1 
 
 		 865 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.60175  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  47.87 
 
 		 842 aa  796    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  49.05 
 
 		 843 aa  799    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  46.93 
 
 		 855 aa  798    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  46.14 
 
 		 859 aa  788    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  41.22 
 
 		 863 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0030  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.1 
 
 		 865 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  50.36 
 
 		 818 aa  843    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1019  ATPase  42.81 
 
 		 857 aa  674    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00163715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2223  ATPase AAA-2  43.28 
 
 		 865 aa  675    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2261  clpB protein  43.39 
 
 		 865 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  47.8 
 
 		 847 aa  777    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1138  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.1 
 
 		 865 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  48.28 
 
 		 841 aa  795    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>