More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1102 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1102  type II secretion system protein E  100 
 
 		 477 aa  984    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00726953  unclonable  0.00000000000588635 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3196  type II general secretion pathway (GSP) E protein  59.87 
 
 		 478 aa  606  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0617  type II secretion system protein E  55.84 
 
 		 467 aa  518  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201563  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  49.08 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.86 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  40.2 
 
 		 558 aa  362  9e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  43.63 
 
 		 522 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  42.66 
 
 		 568 aa  360  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  44.22 
 
 		 497 aa  359  5e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  43.2 
 
 		 515 aa  359  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  42.42 
 
 		 500 aa  359  6e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  43.63 
 
 		 495 aa  359  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  48.66 
 
 		 558 aa  358  8e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  47.87 
 
 		 559 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  48.03 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  46.58 
 
 		 486 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  43.63 
 
 		 497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  43.63 
 
 		 497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  43.63 
 
 		 497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  43.63 
 
 		 497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  43.68 
 
 		 491 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  43.63 
 
 		 497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  52.25 
 
 		 568 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  43.63 
 
 		 497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  43.63 
 
 		 497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.25 
 
 		 568 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.25 
 
 		 568 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.4 
 
 		 568 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  48.21 
 
 		 494 aa  355  1e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  47.14 
 
 		 520 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  46.61 
 
 		 514 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  43.32 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  48.92 
 
 		 787 aa  354  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  47.09 
 
 		 521 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  43.53 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  47.59 
 
 		 571 aa  354  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  46.48 
 
 		 520 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  43.53 
 
 		 498 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  47.47 
 
 		 490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  49.47 
 
 		 520 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  46.48 
 
 		 520 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  47.95 
 
 		 494 aa  353  4e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.45 
 
 		 566 aa  353  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  49.73 
 
 		 571 aa  353  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50 
 
 		 571 aa  353  5e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  43.63 
 
 		 497 aa  353  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  42.39 
 
 		 501 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  43.72 
 
 		 503 aa  352  7e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  44.62 
 
 		 562 aa  352  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.75 
 
 		 568 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  49.07 
 
 		 518 aa  352  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  43.32 
 
 		 499 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  43.32 
 
 		 499 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  46.83 
 
 		 505 aa  351  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  41.84 
 
 		 553 aa  350  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  43.32 
 
 		 499 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.24 
 
 		 568 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  43.32 
 
 		 499 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.3 
 
 		 571 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  42.62 
 
 		 523 aa  350  4e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  46.55 
 
 		 522 aa  349  5e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.89 
 
 		 568 aa  349  5e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  47.29 
 
 		 577 aa  349  7e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.09 
 
 		 568 aa  348  8e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  40.79 
 
 		 558 aa  348  9e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  47.15 
 
 		 503 aa  348  9e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  44.39 
 
 		 871 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  47.58 
 
 		 487 aa  348  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  46.09 
 
 		 520 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.75 
 
 		 568 aa  347  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.23 
 
 		 577 aa  346  4e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  40.76 
 
 		 507 aa  346  5e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  46.26 
 
 		 523 aa  346  6e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  47.85 
 
 		 502 aa  345  8e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  47.11 
 
 		 541 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  47.86 
 
 		 502 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  46.77 
 
 		 469 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  41.3 
 
 		 556 aa  345  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  42.83 
 
 		 495 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2630  type IV pilus assembly protein PilB  46.62 
 
 		 563 aa  344  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  40.86 
 
 		 482 aa  344  2e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  46.4 
 
 		 521 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  46.75 
 
 		 527 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  41.69 
 
 		 565 aa  343  2.9999999999999997e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  41.7 
 
 		 511 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  47.98 
 
 		 514 aa  344  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  44.21 
 
 		 509 aa  343  4e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1044  type II secretion system protein E  44.47 
 
 		 482 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  46.77 
 
 		 469 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  43.62 
 
 		 515 aa  343  5.999999999999999e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  46.77 
 
 		 533 aa  342  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  47.58 
 
 		 746 aa  342  7e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  46.26 
 
 		 524 aa  342  8e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  46.13 
 
 		 521 aa  342  8e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4179  type II secretion system protein E  48.67 
 
 		 482 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.262241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  47.06 
 
 		 553 aa  342  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  46.13 
 
 		 521 aa  341  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  41.87 
 
 		 553 aa  342  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  43.54 
 
 		 523 aa  341  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  47.72 
 
 		 489 aa  341  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>