43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0982 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0982  CBS domain containing protein  100 
 
 
220 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.646716 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3407  hypothetical protein  38.91 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.476966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1048  CBS domain containing protein  33.64 
 
 
219 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3892  CBS domain containing protein  30.77 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0657  CBS domain containing protein  29.15 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2720  CBS domain containing protein  28.7 
 
 
220 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.934738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1694  CBS domain-containing protein  21.66 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04335  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  21.81 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  21.88 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1257  putative signal transduction protein with CBS domains  19.83 
 
 
230 aa  52.4  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00289092  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0902  XRE family transcriptional regulator  25.58 
 
 
230 aa  52  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1043  putative signal transduction protein with CBS domains  21.46 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000177571  hitchhiker  0.0000212984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  22.65 
 
 
230 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  19.62 
 
 
214 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1323  putative signal transduction protein with CBS domains  20.67 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1018  hypothetical protein  17.75 
 
 
230 aa  47  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  21.47 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  25.4 
 
 
141 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  22.4 
 
 
214 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  29.41 
 
 
376 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  21.21 
 
 
141 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  21.21 
 
 
141 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  21.21 
 
 
141 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1116  CBS domain-containing protein  22.06 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.956192  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1304  signal-transduction protein  20 
 
 
200 aa  45.8  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  24.06 
 
 
216 aa  45.4  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  21.85 
 
 
143 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  21.85 
 
 
143 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  19.71 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  21.85 
 
 
143 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  21.33 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  32.04 
 
 
155 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  21.24 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1331  CBS domain-containing protein  19.83 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.576096  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1360  putative signal transduction protein with CBS domains  18.49 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  22.73 
 
 
141 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  20.49 
 
 
863 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1516  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
383 aa  42.4  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000189074  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  45.95 
 
 
146 aa  42  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  23.27 
 
 
208 aa  41.6  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  25 
 
 
586 aa  41.6  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  20.66 
 
 
143 aa  41.6  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  20.66 
 
 
143 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>