More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0855 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0855  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0416487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2512  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.13 
 
 
189 aa  189  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36787  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06115  hypothetical protein  43.85 
 
 
186 aa  186  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1963  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.7 
 
 
191 aa  179  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5958  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.65 
 
 
189 aa  167  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0703891  normal  0.0596228 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1671  SUA5/yciO/yrdC domain protein  45.45 
 
 
185 aa  167  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1428  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.62 
 
 
225 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0807  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.22 
 
 
338 aa  102  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1371  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.5 
 
 
328 aa  101  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1674  Sua5/YciO/YrdC family protein  32.5 
 
 
328 aa  101  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1975  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.26 
 
 
190 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213074  normal  0.800217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5452  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  31.85 
 
 
346 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228845  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.8 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000200463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5174  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  31.85 
 
 
346 aa  97.8  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5009  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  31.85 
 
 
346 aa  97.8  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000874149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5025  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  31.85 
 
 
346 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00487742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5568  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  31.85 
 
 
346 aa  97.8  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00343157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5503  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  31.85 
 
 
346 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5417  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  31.85 
 
 
346 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.7505e-62 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  32.72 
 
 
364 aa  97.8  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5123  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.21 
 
 
346 aa  96.3  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401349  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2151  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.85 
 
 
358 aa  96.3  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0067  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.97 
 
 
338 aa  97.1  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0048533  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0553  translation factor SUA5  36.25 
 
 
328 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5448  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  30.57 
 
 
346 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.011245  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_739  translation factor SUA5  33.13 
 
 
213 aa  95.5  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000652312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2395  translation factor SUA5  33.76 
 
 
352 aa  94  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0096  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.08 
 
 
354 aa  93.6  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.39 
 
 
348 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5504  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  29.94 
 
 
346 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000376853  unclonable  1.14998e-25 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0754  translation factor SUA5  33.13 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00690198  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3463  translation factor SUA5  33.12 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0993793  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0134  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.79 
 
 
193 aa  92.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2777  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.29 
 
 
360 aa  92.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.389142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.33 
 
 
350 aa  92.8  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2174  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.33 
 
 
350 aa  92.8  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143173  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3846  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.57 
 
 
347 aa  92.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00967711  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.03 
 
 
317 aa  92  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0732  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  33.12 
 
 
185 aa  92  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1789  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.77 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0484  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.13 
 
 
337 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1234  translation factor SUA5  32.81 
 
 
198 aa  90.9  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.559123  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0577  hypothetical protein  34.84 
 
 
336 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0507  translation factor SUA5  33.12 
 
 
330 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160879  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4849  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.81 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.48 
 
 
348 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0831  translation factor SUA5  35.44 
 
 
327 aa  89  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.167827  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2466  Sua5/YciO/YrdC family protein  37.04 
 
 
188 aa  89  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00622558  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0139  translation factor SUA5  29.3 
 
 
350 aa  88.6  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.14 
 
 
327 aa  88.2  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1246  putative translation factor (SUA5)  33.12 
 
 
334 aa  88.2  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.377442  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2152  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.87 
 
 
357 aa  88.2  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2190  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.87 
 
 
357 aa  88.2  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.970506  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.73 
 
 
331 aa  87.8  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0497  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.84 
 
 
337 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271479  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1811  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.9 
 
 
362 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4092  translation factor SUA5  34.18 
 
 
321 aa  87  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0034  translation factor SUA5  30.73 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.12599  hitchhiker  0.00900731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0032  translation factor SUA5  30.73 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.86833  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1839  translation factor SUA5  28.09 
 
 
206 aa  87  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.287256  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1813  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.81 
 
 
366 aa  87  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00420003  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2328  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.57 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2103  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.84 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.345955  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003091  YrdC family protein  29.21 
 
 
206 aa  86.3  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0373896  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3871  translation factor SUA5  34.81 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0083  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.08 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00103971  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0562  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  33.33 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.440322  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3885  translation factor SUA5  34.81 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0609362  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0651  translation factor SUA5  36.5 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585338  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3166  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.13 
 
 
354 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126434  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2922  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.66 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3959  translation factor SUA5  34.81 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1843  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.57 
 
 
203 aa  85.9  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00240  hypothetical protein  36.92 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  33.12 
 
 
351 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2120  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.9 
 
 
204 aa  85.9  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.781433  hitchhiker  0.000757724 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.8 
 
 
347 aa  85.5  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.231595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02755  hypothetical protein  29.21 
 
 
206 aa  85.5  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0037  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.28 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1345  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.6 
 
 
358 aa  85.5  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.165171 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.29 
 
 
316 aa  85.1  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.865666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0040  translation factor SUA5  30.17 
 
 
188 aa  85.1  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.123848  hitchhiker  0.00000448294 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0072  ribosome maturation factor  34.72 
 
 
191 aa  84.7  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0436  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.1 
 
 
191 aa  84.7  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0403  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.69 
 
 
316 aa  84.3  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0487  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.61 
 
 
318 aa  84.3  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.18 
 
 
349 aa  84.7  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0041  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.21 
 
 
185 aa  84.3  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00240763  normal  0.264838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0029  SUA5/yciO/yrdC-like protein  31.91 
 
 
188 aa  84.3  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00284591  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0037  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.84 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.95 
 
 
326 aa  84  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0150257  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0901  translation factor SUA5  29.63 
 
 
367 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0029  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.84 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.864856  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.19 
 
 
359 aa  84  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00354892  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3695  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.63 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.641158  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0598  hypothetical protein  31.06 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0735  hypothetical protein  30.63 
 
 
325 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0454  translation factor SUA5  31.65 
 
 
342 aa  84  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0032  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.84 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.94 
 
 
341 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>