More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0854 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  100 
 
 
468 aa  962    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  64.24 
 
 
471 aa  626  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  62.2 
 
 
483 aa  614  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  61.55 
 
 
484 aa  605  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  62.63 
 
 
474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  58.67 
 
 
495 aa  582  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  57.76 
 
 
469 aa  573  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  60.96 
 
 
479 aa  567  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  58.66 
 
 
483 aa  559  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  57.36 
 
 
477 aa  558  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  54.62 
 
 
561 aa  524  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  52.46 
 
 
471 aa  476  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  50.77 
 
 
470 aa  471  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  50.22 
 
 
489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  50.11 
 
 
475 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  49.34 
 
 
479 aa  462  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  49.34 
 
 
476 aa  462  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  49.11 
 
 
475 aa  448  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.87 
 
 
499 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.19 
 
 
502 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3712  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.19 
 
 
507 aa  280  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.72 
 
 
491 aa  280  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
490 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.5 
 
 
483 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 
484 aa  276  8e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  36.04 
 
 
496 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.24 
 
 
492 aa  272  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  38.17 
 
 
552 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  38.43 
 
 
471 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  37.66 
 
 
479 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  38.76 
 
 
471 aa  270  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3362  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.99 
 
 
500 aa  270  4e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4681  HDIG domain-containing protein  37.44 
 
 
483 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  37.76 
 
 
475 aa  265  1e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4223  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.21 
 
 
486 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  39.04 
 
 
483 aa  262  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 
525 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4840  tRNA adenylyltransferase  38.29 
 
 
489 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  37.59 
 
 
488 aa  261  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.78 
 
 
483 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0845  metal dependent phosphohydrolase  35.15 
 
 
497 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325439  normal  0.188962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  33.48 
 
 
483 aa  251  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  35.07 
 
 
480 aa  249  8e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  34.85 
 
 
485 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  34.97 
 
 
523 aa  247  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 
485 aa  247  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7321  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.4 
 
 
508 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5773  metal dependent phosphohydrolase  34.32 
 
 
489 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.626419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5397  metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 
455 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5486  metal dependent phosphohydrolase  34.32 
 
 
489 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.527547  normal  0.550288 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.81 
 
 
462 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5397  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.01 
 
 
464 aa  243  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4494  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.38 
 
 
508 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0150465  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  33.63 
 
 
502 aa  240  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26890  tRNA adenylyltransferase  33.4 
 
 
484 aa  239  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 
473 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.03 
 
 
502 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.95 
 
 
487 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  36.12 
 
 
448 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 
464 aa  203  5e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2803  polynucleotide adenylyltransferase region  29.28 
 
 
510 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 
473 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.47 
 
 
584 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 
450 aa  171  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 
442 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 
448 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31 
 
 
583 aa  167  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 
490 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0314  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.79 
 
 
498 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000179563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0065  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 
467 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000449224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.39 
 
 
465 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_002936  DET0334  polyA polymerase family protein  27.74 
 
 
493 aa  158  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000707313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.7 
 
 
459 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 
454 aa  156  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 
464 aa  156  8e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_276  polymerase  26.75 
 
 
501 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000457601  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.74 
 
 
427 aa  153  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  40.99 
 
 
859 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  27.06 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1521  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.18 
 
 
469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0264  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.31 
 
 
517 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  40.47 
 
 
883 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2216  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.52 
 
 
426 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  36.64 
 
 
888 aa  143  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  36.25 
 
 
875 aa  143  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  39.3 
 
 
877 aa  143  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  35.8 
 
 
898 aa  143  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  35.8 
 
 
880 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  35.83 
 
 
875 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  37.5 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1813  tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme)  27.77 
 
 
437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  39.11 
 
 
880 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  37.02 
 
 
896 aa  141  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  37.5 
 
 
890 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  31.83 
 
 
907 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  28.76 
 
 
492 aa  140  4.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 
875 aa  140  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2984  metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 
414 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.675495  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  34.69 
 
 
863 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3282  metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 
405 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>