More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0805 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 648 aa  1335    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  42.69 
 
 		 600 aa  499  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2015  penicillin-binding protein 2  41.74 
 
 		 664 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.350589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0191  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.86 
 
 		 651 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0246  hypothetical protein  42.18 
 
 		 596 aa  482  1e-134  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  41.69 
 
 		 622 aa  459  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3202  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.62 
 
 		 654 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000159747  normal  0.0376991 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  41.74 
 
 		 619 aa  459  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  41.64 
 
 		 657 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1393  penicillin-binding protein 2, putative  40.73 
 
 		 621 aa  442  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0265808 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  33.9 
 
 		 640 aa  351  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  35.95 
 
 		 610 aa  350  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  34.63 
 
 		 646 aa  343  7e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  36.11 
 
 		 615 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  34.6 
 
 		 639 aa  334  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  34.42 
 
 		 641 aa  332  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 		 643 aa  323  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  33.23 
 
 		 647 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  34.27 
 
 		 636 aa  318  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  33 
 
 		 645 aa  317  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.82 
 
 		 633 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 		 634 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 		 643 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  34.24 
 
 		 647 aa  310  6.999999999999999e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  34.15 
 
 		 766 aa  310  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  34.35 
 
 		 611 aa  308  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 		 642 aa  307  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  34.9 
 
 		 803 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  33.59 
 
 		 801 aa  303  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  34.28 
 
 		 809 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  34.64 
 
 		 802 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  34.64 
 
 		 802 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  34.28 
 
 		 803 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  34.64 
 
 		 802 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  34.44 
 
 		 802 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  34.64 
 
 		 802 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  33.44 
 
 		 673 aa  300  7e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  33.88 
 
 		 645 aa  297  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  34.67 
 
 		 775 aa  297  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 		 646 aa  296  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 		 765 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  33.96 
 
 		 760 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 		 765 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  32.88 
 
 		 646 aa  293  6e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  32.97 
 
 		 793 aa  293  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  31.79 
 
 		 574 aa  291  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  33.59 
 
 		 801 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  33.64 
 
 		 756 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  34.03 
 
 		 800 aa  290  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  33.86 
 
 		 761 aa  289  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  33.69 
 
 		 801 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  33.71 
 
 		 627 aa  289  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  33.07 
 
 		 636 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  32.89 
 
 		 630 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  33.65 
 
 		 764 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  31.99 
 
 		 650 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  32.74 
 
 		 664 aa  281  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  33.22 
 
 		 681 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  31.41 
 
 		 634 aa  280  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  33.01 
 
 		 662 aa  279  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  31.46 
 
 		 640 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  33.6 
 
 		 635 aa  278  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  32.37 
 
 		 646 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 		 618 aa  277  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  30.95 
 
 		 637 aa  277  5e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  32.81 
 
 		 635 aa  276  8e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  32.2 
 
 		 646 aa  276  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  31.29 
 
 		 628 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  32.06 
 
 		 619 aa  275  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.94 
 
 		 609 aa  274  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  33.17 
 
 		 610 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  29.89 
 
 		 643 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  33.23 
 
 		 767 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  33.23 
 
 		 771 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 631 aa  270  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 		 632 aa  270  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  31.54 
 
 		 630 aa  269  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  33.01 
 
 		 655 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  32.71 
 
 		 618 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  32.1 
 
 		 618 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.69 
 
 		 631 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 		 610 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.16 
 
 		 631 aa  267  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 		 648 aa  267  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  30.96 
 
 		 630 aa  266  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  29.71 
 
 		 678 aa  266  8.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 		 618 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  29.8 
 
 		 691 aa  266  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  33.67 
 
 		 669 aa  264  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 		 618 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0357  penicillin-binding protein 2  31.98 
 
 		 681 aa  263  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  29.42 
 
 		 629 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  31.8 
 
 		 627 aa  261  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  30.31 
 
 		 629 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  31.08 
 
 		 629 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  30.61 
 
 		 602 aa  259  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  30.61 
 
 		 602 aa  259  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  32.36 
 
 		 618 aa  259  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  31.65 
 
 		 586 aa  259  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  30.23 
 
 		 637 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>