More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0804 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 421 aa  834    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  49.52 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2014  rod shape-determining protein RodA  51.65 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3304  rod shape-determining protein  50.24 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1454  cell cycle protein  46.67 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0245  hypothetical protein  44.88 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0155  cell cycle protein  43.54 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0190  cell cycle protein  43.76 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0469067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00585  putative transmembrane rod shape-determining protein  46.34 
 
 		 417 aa  335  5.999999999999999e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1392  rod shape-determining protein RodA, putative  37.02 
 
 		 485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.011069 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  36.14 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  35.17 
 
 		 408 aa  226  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  36.62 
 
 		 407 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  38.07 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  39.34 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  36.15 
 
 		 421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  39.3 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  34.69 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  34.06 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  32.75 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  34.67 
 
 		 373 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  35.26 
 
 		 379 aa  203  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  33.8 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  32.45 
 
 		 380 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  34.22 
 
 		 370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  34.09 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  32.17 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  35.5 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  34.22 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  38.24 
 
 		 423 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  32.61 
 
 		 366 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1792  rod shape-determining protein RodA  38.8 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000820178  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  30.58 
 
 		 373 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  31.7 
 
 		 373 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  31.51 
 
 		 373 aa  193  6e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  33.83 
 
 		 369 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  38.46 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  33.67 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  35.86 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  35.86 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  34.12 
 
 		 433 aa  189  7e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  37.84 
 
 		 426 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  32.84 
 
 		 367 aa  189  9e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  34.62 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  32.71 
 
 		 368 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  34.56 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04258  rod shape-determining protein RodA  32.37 
 
 		 372 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239433  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  37.85 
 
 		 422 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  34.52 
 
 		 421 aa  186  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  33.7 
 
 		 368 aa  186  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  34.82 
 
 		 417 aa  186  9e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  37.85 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  30.3 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  35.8 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  30.72 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  32.76 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  34.63 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  35.8 
 
 		 367 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  35.8 
 
 		 367 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  32.93 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  32.93 
 
 		 373 aa  183  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  35.71 
 
 		 412 aa  182  7e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  31.45 
 
 		 373 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  33.8 
 
 		 370 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  33.8 
 
 		 370 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  33.8 
 
 		 370 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  35.05 
 
 		 378 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  33.8 
 
 		 370 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  33.8 
 
 		 370 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  35.67 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  33.09 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  34.63 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  35.8 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  35.8 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  33.8 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  35.8 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0672  rod shape-determining protein  35.67 
 
 		 353 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.722456  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  34.35 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  35.8 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  34.63 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  33.8 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  33.8 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  33.8 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  30.1 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  34.82 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  33.8 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  30.1 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  33.8 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  30.94 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  32.83 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  33.8 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  33.8 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  32.15 
 
 		 438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  32.81 
 
 		 368 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  30.98 
 
 		 373 aa  180  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  34.62 
 
 		 368 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  31.31 
 
 		 360 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  33.63 
 
 		 368 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3450  rod shape-determining protein RodA  32.42 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  34.52 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>