65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0649 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  100 
 
 
154 aa  323  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  58.78 
 
 
153 aa  175  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  55.17 
 
 
154 aa  163  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  51.68 
 
 
155 aa  155  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  50.68 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  49.01 
 
 
152 aa  142  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  52.05 
 
 
155 aa  141  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 
160 aa  141  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  48.63 
 
 
172 aa  138  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  43.05 
 
 
164 aa  137  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  46.31 
 
 
155 aa  136  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 
155 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  49.29 
 
 
154 aa  131  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 
153 aa  130  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  48.3 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  48.3 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  48.3 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 
154 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  45.58 
 
 
174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  44.52 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  44.52 
 
 
166 aa  122  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 
156 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
163 aa  120  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  41.5 
 
 
154 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  47.02 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  45.32 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
168 aa  103  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  43.45 
 
 
154 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
165 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
162 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  36.77 
 
 
324 aa  101  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 
166 aa  84  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 
303 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
146 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
351 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
333 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
322 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 
229 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
310 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  26.47 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1278  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
301 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0992  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  28.38 
 
 
303 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
166 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 
289 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  23.13 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  23.13 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
195 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  26.71 
 
 
308 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.78 
 
 
315 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 
180 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 
170 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  22.97 
 
 
201 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0412  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
174 aa  40.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0161756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>