More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0626 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  79.2 
 
 		 126 aa  206  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  76 
 
 		 125 aa  201  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4367  30S ribosomal protein S13  76 
 
 		 125 aa  199  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128251  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  75.2 
 
 		 125 aa  197  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  72 
 
 		 124 aa  183  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  69.6 
 
 		 124 aa  183  7e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  68 
 
 		 124 aa  176  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0173  30S ribosomal protein S13  68.07 
 
 		 126 aa  173  8e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.190252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 121 aa  168  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  167  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  167  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 124 aa  168  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1914  30S ribosomal protein S13  73.17 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  166  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 121 aa  166  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 121 aa  166  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 121 aa  166  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 121 aa  166  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 121 aa  166  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 121 aa  166  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  64 
 
 		 125 aa  166  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  60.8 
 
 		 126 aa  164  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  64 
 
 		 126 aa  160  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  64.96 
 
 		 127 aa  160  7e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  62.7 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 123 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  59.2 
 
 		 126 aa  159  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  158  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  59.02 
 
 		 122 aa  158  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2399  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 125 aa  157  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000797962  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2205  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 125 aa  157  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000397378  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 127 aa  156  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  60.48 
 
 		 124 aa  156  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  156  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  156  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 123 aa  156  9e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  57.85 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  61.6 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  60.8 
 
 		 125 aa  154  4e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 127 aa  153  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  58.4 
 
 		 126 aa  153  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  62.39 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  60.8 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  57.72 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0204  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 125 aa  150  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  58.68 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  57.72 
 
 		 128 aa  149  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1459  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000394716  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 123 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>