More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0622 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 
444 aa  880  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  58.72 
 
 
437 aa  528  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1635  preprotein translocase subunit SecY  60.41 
 
 
447 aa  521  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5767  preprotein translocase, SecY subunit  60.96 
 
 
439 aa  516  1e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.800902 
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  60.32 
 
 
446 aa  502  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  53.85 
 
 
438 aa  491  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  55.15 
 
 
440 aa  488  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  55.83 
 
 
447 aa  481  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0177  preprotein translocase subunit SecY  53.65 
 
 
435 aa  472  1e-132  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.158062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0377  preprotein translocase subunit SecY  55.2 
 
 
448 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  56.82 
 
 
447 aa  466  1e-130  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  52.62 
 
 
443 aa  456  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  52.61 
 
 
443 aa  450  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  2.11329e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  51.7 
 
 
443 aa  445  1e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  52.39 
 
 
441 aa  445  1e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  7.25785e-06  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  51.02 
 
 
443 aa  444  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  50.11 
 
 
443 aa  439  1e-122  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  51.93 
 
 
441 aa  436  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  48.01 
 
 
447 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  47.78 
 
 
447 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  47.44 
 
 
447 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  43.93 
 
 
420 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  45.35 
 
 
435 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  42.79 
 
 
446 aa  366  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  46.48 
 
 
445 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 
435 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  42.98 
 
 
500 aa  364  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  45.06 
 
 
429 aa  363  5e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  42.14 
 
 
435 aa  362  8e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  8.11889e-07 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  41.82 
 
 
435 aa  359  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  42.99 
 
 
435 aa  358  7e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  41.4 
 
 
437 aa  358  1e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  45.45 
 
 
444 aa  356  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 
418 aa  355  7e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  43.95 
 
 
443 aa  355  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  41.31 
 
 
424 aa  354  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  41.14 
 
 
435 aa  353  3e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02472e-07 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  43.51 
 
 
435 aa  353  3e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.16119e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  42.4 
 
 
435 aa  353  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  43.49 
 
 
443 aa  353  4e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  42.69 
 
 
421 aa  352  9e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.48 
 
 
463 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  44.34 
 
 
443 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  42.25 
 
 
421 aa  348  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  43.59 
 
 
429 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  41.84 
 
 
419 aa  346  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  43.42 
 
 
443 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  44.11 
 
 
443 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1399  preprotein translocase, SecY subunit  42.43 
 
 
446 aa  345  8e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.57 
 
 
442 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.52006e-07  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  43.45 
 
 
443 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  43.72 
 
 
445 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  42.47 
 
 
437 aa  343  3e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  42.56 
 
 
448 aa  342  5e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  41.52 
 
 
435 aa  341  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  43.39 
 
 
431 aa  341  2e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  43.49 
 
 
443 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 
446 aa  340  3e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  44.78 
 
 
446 aa  338  1e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  42.37 
 
 
437 aa  338  1e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  43.19 
 
 
448 aa  337  2e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  44.78 
 
 
446 aa  337  2e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  41.82 
 
 
444 aa  338  2e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  4.20552e-06 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 
446 aa  336  4e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 
446 aa  336  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  43.16 
 
 
445 aa  336  6e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  41.67 
 
 
448 aa  335  9e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  42.69 
 
 
449 aa  335  9e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  43.52 
 
 
430 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  41.47 
 
 
441 aa  334  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  42.53 
 
 
435 aa  334  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.7617e-05  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  42.29 
 
 
447 aa  332  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  39.68 
 
 
443 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  2.66535e-11 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  39.68 
 
 
443 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  42.29 
 
 
447 aa  332  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  39.21 
 
 
423 aa  332  8e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  41.8 
 
 
437 aa  332  9e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  41.28 
 
 
434 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  41.57 
 
 
434 aa  331  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  39.82 
 
 
426 aa  332  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  42.23 
 
 
430 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  41.07 
 
 
446 aa  330  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.08952e-07  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  43.58 
 
 
448 aa  331  2e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  39.01 
 
 
441 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  41.07 
 
 
444 aa  331  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  2.28975e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  41.26 
 
 
446 aa  331  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.09869e-07  unclonable  1.21988e-08 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  41.78 
 
 
437 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  42.52 
 
 
447 aa  331  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  41.72 
 
 
437 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  41.72 
 
 
442 aa  331  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  41.57 
 
 
434 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.78926e-09 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  40.84 
 
 
444 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  40.83 
 
 
434 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  40.78 
 
 
437 aa  330  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  41.03 
 
 
446 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.58427e-07  unclonable  8.37901e-11 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  41.06 
 
 
434 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  40.83 
 
 
434 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.32806e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  41.34 
 
 
434 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  41.11 
 
 
433 aa  330  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  41.34 
 
 
433 aa  329  5e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>