More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0618 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  100 
 
 		 117 aa  231  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  58.41 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  63.73 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  62.75 
 
 		 118 aa  136  8.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  60.68 
 
 		 116 aa  136  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  62.18 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  56.41 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  65.05 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  56.78 
 
 		 118 aa  133  6.0000000000000005e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  58.47 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  56.78 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  65 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  63.46 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  55.93 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  58.82 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  62.75 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  60.58 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  58.1 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  59.29 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1835  50S ribosomal protein L18  56.9 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  52.89 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  57.8 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  57.8 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0305  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 119 aa  125  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  58.1 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  56.64 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  55.75 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  56.48 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  53.1 
 
 		 114 aa  123  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  58.25 
 
 		 120 aa  123  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  56.64 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  55.75 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  56.86 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  56.86 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  55 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  56.14 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  54.87 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  55.75 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  54.87 
 
 		 120 aa  120  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  53.04 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  53.98 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  55.14 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  62.37 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  54.13 
 
 		 123 aa  120  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  55.26 
 
 		 119 aa  120  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  61.05 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  56.14 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  57.43 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  55.77 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  57.43 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  53.66 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  55.26 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  56.76 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  57.55 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  49.58 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  51.24 
 
 		 122 aa  117  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  53.98 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2982  50S ribosomal protein L18  61.05 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.864504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  53.15 
 
 		 118 aa  117  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  51.22 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  52.14 
 
 		 116 aa  116  7.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  58.59 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  58.59 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  51.3 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  57.84 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2185  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.954863  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  56.86 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  55.88 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2463  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  52.83 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  58.25 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2280  50S ribosomal protein L18  50.43 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000151304  hitchhiker  0.00323172 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  53.92 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1571  ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2048  50S ribosomal protein L18  50.88 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00722751  normal  0.437554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>