More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0612 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  100 
 
 		 122 aa  242  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4353  ribosomal protein L14  90.98 
 
 		 122 aa  224  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000335969  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  91.8 
 
 		 122 aa  224  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3152  50S ribosomal protein L14P  88.52 
 
 		 122 aa  219  8e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  83.61 
 
 		 122 aa  206  6e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 		 122 aa  206  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 		 122 aa  205  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1625  ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  200  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  81.15 
 
 		 122 aa  199  9e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  196  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  193  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23700  LSU ribosomal protein L14P  75.41 
 
 		 122 aa  193  7e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0331269  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20770  LSU ribosomal protein L14P  74.59 
 
 		 122 aa  190  6e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  190  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17060  LSU ribosomal protein L14P  74.59 
 
 		 122 aa  190  6e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000553202  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  190  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  190  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  190  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5037  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000278288  normal  0.502921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29640  LSU ribosomal protein L14P  74.59 
 
 		 122 aa  188  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2286  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  186  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000233129  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  71.31 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1928  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 121 aa  184  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1096  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2054  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000371952  normal  0.398869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  183  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4305  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.59616  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3913  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2636  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.499658  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0191  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00380745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1841  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0521679  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0121  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.666809  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0592  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2413  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000959501  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3985  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  180  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1302  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1384  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000822769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0114  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000639835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1275  ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  176  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3895  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  176  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  176  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0120  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000694706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0151  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0120  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0116  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.32667e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0114  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0120  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5185  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000182859  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0141  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000080176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0132  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.09851e-62 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0115  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1897  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2897  ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1821  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.27073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2267  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  174  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000819494  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2308  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  174  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000566046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4016  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  174  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0331608  hitchhiker  0.0000209267 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0068  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3014  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0637161  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  173  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1175  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.095268  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1350  ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000461836  hitchhiker  0.00000100945 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  68.85 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0206  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0432  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000188868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0768  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000575392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>