More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0609 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  100 
 
 		 140 aa  278  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1154  50S ribosomal protein L16  78.1 
 
 		 139 aa  226  9e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000032781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4350  50S ribosomal protein L16  78.17 
 
 		 142 aa  224  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215077  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  72.86 
 
 		 140 aa  223  5.0000000000000005e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  76.81 
 
 		 139 aa  223  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1931  50S ribosomal protein L16  78.83 
 
 		 144 aa  223  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5780  ribosomal protein L16  77.7 
 
 		 143 aa  220  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.742745  normal  0.418872 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  73.57 
 
 		 140 aa  219  8e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05750  50S ribosomal protein L16  75.91 
 
 		 141 aa  218  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748802  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  72.99 
 
 		 139 aa  217  5e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0390  50S ribosomal protein L16  74.82 
 
 		 141 aa  213  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  72.99 
 
 		 139 aa  213  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  72.26 
 
 		 139 aa  212  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  71.32 
 
 		 139 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  70.07 
 
 		 139 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 139 aa  210  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 139 aa  201  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  69.12 
 
 		 139 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 145 aa  199  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  70.15 
 
 		 139 aa  200  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 142 aa  199  8e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  69.29 
 
 		 144 aa  199  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  67.63 
 
 		 142 aa  197  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  68.12 
 
 		 138 aa  196  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 139 aa  196  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 139 aa  196  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 		 144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  65.47 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  65.47 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 144 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  63.57 
 
 		 140 aa  193  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 145 aa  193  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 		 140 aa  191  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  62.86 
 
 		 140 aa  191  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 137 aa  191  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 144 aa  190  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2743  50S ribosomal protein L16  69.4 
 
 		 139 aa  190  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.059862  normal  0.198129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  62.86 
 
 		 140 aa  189  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 		 142 aa  189  9e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  63.57 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3441  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 151 aa  188  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  60.71 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  60.71 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 137 aa  187  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0334  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 138 aa  187  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 138 aa  187  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.000000000243822 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 		 179 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  63.83 
 
 		 144 aa  187  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 144 aa  186  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 145 aa  187  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 138 aa  187  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  186  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1122  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 161 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 161 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 137 aa  184  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  60.28 
 
 		 160 aa  183  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0458  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 149 aa  183  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 144 aa  182  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 140 aa  182  9e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0481  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  65.71 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  63.77 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0573  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  62.86 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 160 aa  181  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0412  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000749036  normal  0.231316 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 160 aa  181  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1371  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237512  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1868  50S ribosomal protein L16  62.59 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  63.04 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2074  50S ribosomal protein L16  62.59 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0136024  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1697  50S ribosomal protein L16  62.59 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000686182  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1788  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0987623  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_002620  TC0808  50S ribosomal protein L16  63.04 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0752891  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0369  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 158 aa  180  6e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3629  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183832  normal  0.899526 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3629  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000850628  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3702  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3737  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980625  normal  0.023864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>