More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0543 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 471 aa  976    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  65 
 
 		 463 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  63.3 
 
 		 470 aa  615  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  59.83 
 
 		 470 aa  595  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  60.34 
 
 		 471 aa  589  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  59.91 
 
 		 466 aa  585  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  57.32 
 
 		 471 aa  577  1.0000000000000001e-163  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  58.94 
 
 		 472 aa  567  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  55.08 
 
 		 470 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  53.32 
 
 		 471 aa  503  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  52.41 
 
 		 467 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  43.64 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  43.64 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  42.61 
 
 		 459 aa  363  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  42.76 
 
 		 459 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  42.76 
 
 		 459 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  42.76 
 
 		 459 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 		 461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  40.17 
 
 		 459 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  39 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  37.61 
 
 		 459 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  38.5 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  36.31 
 
 		 476 aa  282  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  35.18 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  32.59 
 
 		 617 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  36.73 
 
 		 467 aa  262  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  34.75 
 
 		 480 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  36.8 
 
 		 456 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  34.77 
 
 		 470 aa  259  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  35.73 
 
 		 469 aa  259  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.39 
 
 		 480 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 		 471 aa  256  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  34.97 
 
 		 466 aa  256  7e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  34.61 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  35.24 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.23 
 
 		 478 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  34.05 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.92 
 
 		 478 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  32.92 
 
 		 478 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.71 
 
 		 478 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  35.36 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32.71 
 
 		 484 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32.71 
 
 		 484 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.78 
 
 		 478 aa  240  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 		 478 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  33.4 
 
 		 476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 		 484 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  33.12 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.91 
 
 		 456 aa  226  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  33.63 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  30.75 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  33.68 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  32.66 
 
 		 462 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  34.06 
 
 		 453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  31.26 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  31.26 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  30.39 
 
 		 442 aa  209  7e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  32.84 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  31.24 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 		 464 aa  203  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 		 470 aa  203  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.56 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  31.98 
 
 		 472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  30.27 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  30.27 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  30.27 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  33.47 
 
 		 469 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  28.73 
 
 		 455 aa  192  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 450 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  31.35 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  32.01 
 
 		 471 aa  187  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.24 
 
 		 453 aa  186  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 476 aa  183  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.93 
 
 		 502 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  29.54 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  27.9 
 
 		 452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 		 489 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 		 488 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 		 470 aa  159  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 		 452 aa  156  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  41.43 
 
 		 244 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 		 478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  39.42 
 
 		 243 aa  150  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  26.91 
 
 		 470 aa  150  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  25.83 
 
 		 454 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  35.54 
 
 		 246 aa  145  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  38.86 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 		 243 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 		 243 aa  141  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  37.12 
 
 		 390 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 		 243 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  38.81 
 
 		 244 aa  137  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  34.59 
 
 		 397 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  24.94 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  28.41 
 
 		 361 aa  123  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 		 378 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0381  metallo-beta-lactamase family protein  33.91 
 
 		 246 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0424  metallo-beta-lactamase family protein  33.91 
 
 		 246 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>