More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0529 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 173 aa  358  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  43.87 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  46.99 
 
 		 196 aa  140  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  41.77 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  42.31 
 
 		 624 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  48.08 
 
 		 616 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  47.77 
 
 		 876 aa  132  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  47.06 
 
 		 600 aa  131  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  47.77 
 
 		 629 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  44.87 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  50.34 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  42.68 
 
 		 652 aa  121  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  42.36 
 
 		 349 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  42.36 
 
 		 348 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  42.36 
 
 		 349 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  39.24 
 
 		 339 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  39.31 
 
 		 335 aa  115  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  41.67 
 
 		 652 aa  114  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  42.38 
 
 		 553 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  40.13 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  39.88 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  39.87 
 
 		 617 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  40.27 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3226  Na+/H+ antiporter NhaA  40.76 
 
 		 627 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0579  hypothetical protein  34.39 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  40.28 
 
 		 354 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  41.61 
 
 		 262 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  40.76 
 
 		 664 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0111  DSBA oxidoreductase  40.99 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  38.67 
 
 		 265 aa  104  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3118  Na+/H+ antiporter NhaA  41.77 
 
 		 644 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.875307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  37.65 
 
 		 613 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  37.65 
 
 		 613 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  37.65 
 
 		 613 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  39.73 
 
 		 173 aa  103  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  38.19 
 
 		 263 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  38.61 
 
 		 617 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  35.62 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  40.69 
 
 		 249 aa  101  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  35.9 
 
 		 235 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  36.13 
 
 		 265 aa  95.9  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3230  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  35.22 
 
 		 268 aa  95.5  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  34.19 
 
 		 247 aa  95.1  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  39.6 
 
 		 671 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  39.6 
 
 		 671 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 263 aa  94.7  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  40.38 
 
 		 279 aa  94.4  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1537  Na+/H+ antiporter NhaA  36.91 
 
 		 624 aa  93.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192352  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  40.38 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  35.33 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  38.61 
 
 		 220 aa  92.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  36.31 
 
 		 229 aa  91.7  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 		 270 aa  92  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  37.16 
 
 		 671 aa  91.7  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  33.72 
 
 		 256 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 		 214 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  36.73 
 
 		 224 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  34.75 
 
 		 307 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  34.91 
 
 		 214 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 313 aa  89.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  35.81 
 
 		 296 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 256 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  36.2 
 
 		 218 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  37.75 
 
 		 630 aa  89  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  37.5 
 
 		 244 aa  89  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  37.27 
 
 		 217 aa  88.2  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  33.93 
 
 		 241 aa  87.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 269 aa  87.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  32.9 
 
 		 276 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  41.43 
 
 		 227 aa  87  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  37.35 
 
 		 230 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  33.99 
 
 		 273 aa  86.3  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  33.99 
 
 		 276 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 		 262 aa  85.5  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 		 253 aa  85.1  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  37.04 
 
 		 220 aa  85.1  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  38.62 
 
 		 223 aa  85.1  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  33.1 
 
 		 242 aa  85.1  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.37 
 
 		 270 aa  84.7  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  32.92 
 
 		 267 aa  84.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  35.33 
 
 		 269 aa  84.3  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 		 306 aa  84.3  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  33.72 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  33.72 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  34.87 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  32.91 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  37.86 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  33.72 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  36.76 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  34.64 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  30.87 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  36.08 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  34 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>