193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0502 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 677 aa  1410    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  41.87 
 
 		 642 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  43.29 
 
 		 629 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  41.44 
 
 		 638 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  39.39 
 
 		 629 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  38.77 
 
 		 638 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  37.37 
 
 		 646 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  28.93 
 
 		 599 aa  227  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 600 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  27.58 
 
 		 620 aa  203  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 565 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 587 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  31.53 
 
 		 584 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 564 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 593 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 594 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  26.15 
 
 		 666 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 617 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  27.87 
 
 		 571 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 584 aa  95.5  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 557 aa  95.1  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  22.97 
 
 		 587 aa  94  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 568 aa  91.3  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 673 aa  90.5  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  24.36 
 
 		 582 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  36.05 
 
 		 568 aa  87  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  36.31 
 
 		 568 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  37.72 
 
 		 505 aa  77.4  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  29.23 
 
 		 559 aa  77.4  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  30.97 
 
 		 582 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 582 aa  77  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  37.91 
 
 		 531 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  32.17 
 
 		 555 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  34.27 
 
 		 579 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 527 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  32.43 
 
 		 529 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  33.17 
 
 		 531 aa  70.5  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  23.63 
 
 		 615 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 548 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  32.93 
 
 		 527 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  39.18 
 
 		 511 aa  69.7  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  32.92 
 
 		 583 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 631 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 561 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  30.63 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  33.12 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  22.86 
 
 		 601 aa  67.8  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 566 aa  66.6  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  31.01 
 
 		 477 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  28.7 
 
 		 523 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 550 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  31.27 
 
 		 556 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  27.73 
 
 		 541 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  29.87 
 
 		 549 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 614 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 625 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  32.92 
 
 		 540 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 595 aa  63.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  30.32 
 
 		 498 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  32 
 
 		 489 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 603 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 613 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  31.51 
 
 		 627 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  35.29 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 497 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 460 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 503 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.08 
 
 		 479 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  23.44 
 
 		 565 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 540 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 495 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  30.95 
 
 		 540 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  34.43 
 
 		 487 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.87 
 
 		 494 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  31.41 
 
 		 499 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  22.4 
 
 		 607 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  22.7 
 
 		 664 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  35.96 
 
 		 581 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  35.29 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 537 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  29.61 
 
 		 481 aa  57.4  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  31.18 
 
 		 557 aa  57.4  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  23.67 
 
 		 623 aa  57.4  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  34.15 
 
 		 511 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 511 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  31.34 
 
 		 484 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1782  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 510 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  32.5 
 
 		 573 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 508 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  34.44 
 
 		 507 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  32.43 
 
 		 534 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 561 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 576 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.27 
 
 		 490 aa  55.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 477 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>