More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0501 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  45.22 
 
 		 1068 aa  912    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1086 aa  2218    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  44.97 
 
 		 1062 aa  895    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  42.42 
 
 		 1081 aa  821    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  49.18 
 
 		 1176 aa  958    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  47.19 
 
 		 1056 aa  913    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  43.54 
 
 		 1148 aa  818    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1130 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 1006 aa  533  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1033 aa  510  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 		 1123 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1109 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 1027 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 1033 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1029 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 1061 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 1144 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1036 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 1045 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1094 aa  418  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1056 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1043 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 1056 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 1145 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 		 1127 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 937 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 953 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1079 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 1086 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1095 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1131 aa  373  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1095 aa  358  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1181 aa  349  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 913 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 1130 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1128 aa  340  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1038 aa  336  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1047 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1142 aa  334  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 		 1036 aa  334  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 1025 aa  330  9e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 1013 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 986 aa  327  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1124 aa  327  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1128 aa  326  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1046 aa  324  7e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1036 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1148 aa  322  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1116 aa  321  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1155 aa  321  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 1177 aa  320  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1079 aa  320  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1164 aa  319  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1053 aa  318  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 982 aa  318  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1148 aa  311  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 1038 aa  308  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1146 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 1074 aa  304  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 1050 aa  304  7.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 929 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1128 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1077 aa  302  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 1029 aa  301  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1011 aa  300  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 1004 aa  300  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1066 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 1039 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1052 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  29.24 
 
 		 1043 aa  297  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1006 aa  295  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1008 aa  295  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 1192 aa  295  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1079 aa  289  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1081 aa  287  9e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1173 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 		 1104 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 1006 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1161 aa  282  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 1023 aa  282  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1058 aa  281  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1064 aa  281  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 1177 aa  279  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 1020 aa  279  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1053 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 1010 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 1036 aa  276  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1071 aa  275  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 1036 aa  274  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 1198 aa  274  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 1037 aa  274  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 1065 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 1058 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1161 aa  272  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1132 aa  271  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1202 aa  271  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 1065 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 976 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  25.16 
 
 		 1041 aa  269  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 1055 aa  268  5e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>