209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0482 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  100 
 
 		 241 aa  488  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  41.57 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3810  Rhomboid family protein  37.97 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.450903  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0861  Rhomboid family protein  38.66 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5568  Rhomboid family protein  36.09 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  45.37 
 
 		 238 aa  151  8.999999999999999e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  36.25 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  34.92 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  39.32 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0015  rhomboid family membrane protein  33.33 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  36.84 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  35.96 
 
 		 220 aa  132  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  37.34 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  38.63 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0633  hypothetical protein  34.57 
 
 		 263 aa  129  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  36.28 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  37.17 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  38.86 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  35.4 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  33.77 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  33.61 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  34.82 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  35.68 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  32.61 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  37.5 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  35.11 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  33.04 
 
 		 196 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  31.3 
 
 		 285 aa  95.9  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  29 
 
 		 197 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  31.16 
 
 		 238 aa  92.8  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  32.6 
 
 		 198 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  29.96 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  35.23 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  30.69 
 
 		 234 aa  85.5  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4542  Rhomboid family protein  36.9 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483276 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4409  Rhomboid family protein  36.9 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.824835 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  29.73 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  29.73 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  29.73 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  29.73 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  29.73 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  29.73 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  29.73 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  30.27 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  31.08 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  32.39 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  28.83 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  27.46 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  26.04 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  31.64 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  28.11 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  28.19 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  26.73 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  32.77 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  30.09 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  27.84 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  27.23 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  27.2 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  29.35 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  29.14 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  31.67 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  29.38 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  28.76 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  26.74 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  29.28 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  27.39 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  29.1 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  32.58 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  28.4 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  27.32 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  29.28 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  27.46 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  28.65 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  30.53 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  29.28 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5567  Rhomboid family protein  30.9 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  24.88 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  28.41 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  27.23 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  30.34 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  31.05 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  26.5 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  32.76 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0788  Rhomboid family protein  31.76 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0483  Rhomboid family protein  26.55 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  26.29 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  36.04 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  29.69 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  26.96 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  25.42 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  29.55 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  32.95 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2016  rhomboid-like protein  29.27 
 
 		 504 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  27.75 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  28.73 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  31.18 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  25.11 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  31.55 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0239  rhomboid family protein  28.18 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.270318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  29.41 
 
 		 360 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>