More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0479 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  100 
 
 		 603 aa  1248    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  50.27 
 
 		 597 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.16 
 
 		 1018 aa  355  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  36.41 
 
 		 1012 aa  354  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  37.46 
 
 		 992 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.11 
 
 		 1002 aa  340  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  35.17 
 
 		 971 aa  334  3e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  35.13 
 
 		 1007 aa  330  3e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  36.33 
 
 		 990 aa  325  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.9 
 
 		 953 aa  302  9e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  34.31 
 
 		 997 aa  284  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.35 
 
 		 976 aa  282  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  30.85 
 
 		 1003 aa  256  6e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  33.54 
 
 		 966 aa  242  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  33.67 
 
 		 434 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  36.41 
 
 		 434 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  36.41 
 
 		 434 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  36.25 
 
 		 433 aa  200  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  34.64 
 
 		 793 aa  200  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  36.25 
 
 		 434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  35.75 
 
 		 434 aa  198  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  34.09 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  34.92 
 
 		 452 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  34.92 
 
 		 428 aa  197  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  36 
 
 		 434 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  34.3 
 
 		 385 aa  192  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  32.75 
 
 		 395 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  32.97 
 
 		 390 aa  182  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  32.23 
 
 		 381 aa  179  9e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  34.38 
 
 		 432 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  34.38 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  32.73 
 
 		 566 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  32.43 
 
 		 574 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  34.14 
 
 		 432 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  34.14 
 
 		 432 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  34.14 
 
 		 432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  32.72 
 
 		 379 aa  174  5.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  31.63 
 
 		 379 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  34.53 
 
 		 591 aa  167  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  31.81 
 
 		 430 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.08 
 
 		 582 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  32.91 
 
 		 665 aa  163  7e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  30.94 
 
 		 784 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  30.68 
 
 		 408 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  31.2 
 
 		 651 aa  159  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.73 
 
 		 381 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  32.59 
 
 		 391 aa  158  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  32.97 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  29.97 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  27.12 
 
 		 531 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  27.48 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  27.48 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  30.18 
 
 		 360 aa  154  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  31.02 
 
 		 381 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  30.73 
 
 		 381 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  30.15 
 
 		 717 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  29.44 
 
 		 796 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  29.44 
 
 		 796 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  30.66 
 
 		 361 aa  150  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  27.29 
 
 		 471 aa  148  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  29.86 
 
 		 395 aa  146  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  31.47 
 
 		 790 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  31.66 
 
 		 785 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  31.58 
 
 		 792 aa  144  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  30.68 
 
 		 392 aa  144  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  31.48 
 
 		 351 aa  143  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  30 
 
 		 818 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  33.24 
 
 		 357 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  29.75 
 
 		 338 aa  141  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  29.7 
 
 		 483 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  30.64 
 
 		 361 aa  139  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  29.82 
 
 		 375 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  31.59 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  32.71 
 
 		 344 aa  134  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  30.43 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  28.76 
 
 		 354 aa  130  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  28.86 
 
 		 336 aa  126  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  30.79 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  28.39 
 
 		 334 aa  123  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  30.03 
 
 		 348 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  28.14 
 
 		 416 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  26.35 
 
 		 394 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  28.69 
 
 		 447 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  30.36 
 
 		 369 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  26.52 
 
 		 433 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  24.83 
 
 		 496 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2590  beta-lactamase  29.14 
 
 		 333 aa  111  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  26.38 
 
 		 440 aa  107  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  25.51 
 
 		 415 aa  107  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3541  beta-lactamase  27.72 
 
 		 394 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437558  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3394  Beta-lactamase  27.21 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  26.87 
 
 		 397 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3477  beta-lactamase  27.48 
 
 		 394 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  25.93 
 
 		 364 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  28.05 
 
 		 339 aa  97.4  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  23.6 
 
 		 424 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  26.88 
 
 		 347 aa  95.1  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  27.25 
 
 		 426 aa  94.4  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3866  beta-lactamase  25 
 
 		 388 aa  92.8  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  26.73 
 
 		 370 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>