More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0478 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  55.52 
 
 		 618 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  55.52 
 
 		 618 aa  642    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  100 
 
 		 611 aa  1241    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  55.52 
 
 		 618 aa  643    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  55.56 
 
 		 615 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  54.44 
 
 		 623 aa  635    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  55.92 
 
 		 615 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  58.22 
 
 		 619 aa  712    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  64.34 
 
 		 616 aa  812    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  54.25 
 
 		 626 aa  650    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  51.49 
 
 		 638 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  44.3 
 
 		 623 aa  518  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  42.42 
 
 		 625 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  41.83 
 
 		 609 aa  465  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  40.77 
 
 		 625 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  40.13 
 
 		 621 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  40.3 
 
 		 621 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  40.31 
 
 		 604 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  40.6 
 
 		 621 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  39.35 
 
 		 611 aa  412  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  40.34 
 
 		 603 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.07 
 
 		 603 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  37.8 
 
 		 592 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  37.54 
 
 		 613 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  40.03 
 
 		 625 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  35.9 
 
 		 614 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  36.75 
 
 		 613 aa  359  9e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.61 
 
 		 600 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  34.78 
 
 		 618 aa  347  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  34.18 
 
 		 626 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  32.14 
 
 		 605 aa  302  9e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  36.53 
 
 		 606 aa  300  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  32.42 
 
 		 621 aa  291  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  34.24 
 
 		 608 aa  289  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  34.63 
 
 		 608 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  29.11 
 
 		 597 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  32.23 
 
 		 616 aa  275  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  31.23 
 
 		 619 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  32.62 
 
 		 616 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  29.05 
 
 		 608 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  29.79 
 
 		 605 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  28.04 
 
 		 594 aa  270  8e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  30.49 
 
 		 611 aa  269  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  33.02 
 
 		 566 aa  266  5.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.94 
 
 		 587 aa  266  5.999999999999999e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  33.07 
 
 		 626 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  30.82 
 
 		 595 aa  262  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  40.7 
 
 		 599 aa  257  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  29.45 
 
 		 604 aa  256  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.65 
 
 		 633 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  28.41 
 
 		 603 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  28.41 
 
 		 603 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  30.88 
 
 		 596 aa  250  6e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  29 
 
 		 618 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  33.4 
 
 		 662 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  31.92 
 
 		 578 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  30.1 
 
 		 596 aa  243  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  30.87 
 
 		 627 aa  240  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  33.78 
 
 		 623 aa  240  6.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  29.07 
 
 		 624 aa  238  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  28.86 
 
 		 606 aa  236  8e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  29.78 
 
 		 633 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  35.84 
 
 		 673 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  31.42 
 
 		 653 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  29.48 
 
 		 611 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  28.83 
 
 		 611 aa  229  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  30.1 
 
 		 726 aa  227  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  30.85 
 
 		 582 aa  226  9e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  30.81 
 
 		 593 aa  226  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  34.92 
 
 		 631 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  30.53 
 
 		 647 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  29.52 
 
 		 764 aa  223  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  28.62 
 
 		 586 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  28.69 
 
 		 617 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  25.88 
 
 		 591 aa  219  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0029  ABC transporter ATP-binding protein  27.99 
 
 		 592 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0444277  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.84 
 
 		 614 aa  217  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.45 
 
 		 586 aa  217  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.2 
 
 		 586 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.52 
 
 		 586 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  29.65 
 
 		 625 aa  216  8e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  29.06 
 
 		 782 aa  216  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  28.45 
 
 		 586 aa  216  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.45 
 
 		 586 aa  216  9e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.45 
 
 		 586 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  37.26 
 
 		 596 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  28.28 
 
 		 586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  31.44 
 
 		 778 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.28 
 
 		 586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  35.28 
 
 		 618 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.05 
 
 		 618 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  34.39 
 
 		 598 aa  213  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  34 
 
 		 604 aa  213  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  36.89 
 
 		 626 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.85 
 
 		 575 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  28.1 
 
 		 586 aa  213  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.79 
 
 		 618 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  36.28 
 
 		 610 aa  213  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  31.91 
 
 		 773 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.29 
 
 		 622 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>