170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0418 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0418  peptidase A8 signal peptidase II  100 
 
 		 200 aa  397  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.216588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0234  Lipoprotein signal peptidase-like protein  51.96 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02475  putative signal peptidase  51.87 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0700  lipoprotein signal peptidase  50.26 
 
 		 199 aa  181  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1598  lipoprotein signal peptidase  52.17 
 
 		 226 aa  164  6.9999999999999995e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.698067 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2030  lipoprotein signal peptidase  47.54 
 
 		 198 aa  157  9e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3677  signal peptidase II  42.71 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.273504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5729  Lipoprotein signal peptidase-like protein  46.63 
 
 		 261 aa  146  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4392  lipoprotein signal peptidase  42.2 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000433749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  41.42 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0018  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 		 236 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 169 aa  84.7  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  28.65 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  30.81 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  29.89 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  28.9 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  31.4 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  30.73 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  32.16 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  28.65 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  28.65 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  32.8 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  32.8 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  32.8 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  32.8 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  31.74 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  29.65 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1775  lipoprotein signal peptidase  28.74 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  29.1 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  25.88 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  29.02 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  27.6 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  30.27 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  32.54 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  31.89 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  32.54 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  32.49 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  32.54 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  29.44 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  25.84 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  29.41 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  32.94 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  31.95 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  27.96 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  29.24 
 
 		 150 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  30.05 
 
 		 173 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  29.31 
 
 		 153 aa  52.8  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  29.31 
 
 		 173 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  25.71 
 
 		 161 aa  52  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  30.9 
 
 		 166 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  31.52 
 
 		 170 aa  52  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  30 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  30.34 
 
 		 166 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  26.47 
 
 		 148 aa  51.6  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  28.99 
 
 		 160 aa  51.6  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  27.33 
 
 		 160 aa  51.2  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  31.64 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  29.05 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  27.6 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  31.64 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  31.64 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  31.64 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  31.64 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  31.64 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  31.64 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  31.64 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  26.63 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  27.59 
 
 		 159 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  28.83 
 
 		 163 aa  49.7  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0013  lipoprotein signal peptidase  27.34 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0013  lipoprotein signal peptidase  27.34 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  26.78 
 
 		 163 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  28.66 
 
 		 161 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  29.63 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  30.34 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  27.49 
 
 		 170 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  31.28 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  31.28 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  31.28 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  31.18 
 
 		 152 aa  49.3  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  33.9 
 
 		 171 aa  48.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  26.09 
 
 		 173 aa  48.5  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  28.82 
 
 		 158 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  29.78 
 
 		 166 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  31.18 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  24.86 
 
 		 158 aa  48.5  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0013  lipoprotein signal peptidase  28.06 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  29.44 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  32.5 
 
 		 178 aa  48.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  29.17 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  26.23 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  27.81 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  33.08 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  29.76 
 
 		 358 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  26.59 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  27.17 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  27.81 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  29.01 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  30.49 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>