168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0405 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
400 aa  827    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  31 
 
 
397 aa  217  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  27.79 
 
 
404 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
410 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  24.15 
 
 
413 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
403 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  22.38 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 
412 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
421 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
389 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  21.67 
 
 
414 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  22.68 
 
 
404 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 
402 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  23.34 
 
 
402 aa  106  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  28.57 
 
 
402 aa  106  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 
406 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  21.79 
 
 
402 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
406 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 
456 aa  99.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  20.59 
 
 
402 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  22.5 
 
 
405 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 
396 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  22.55 
 
 
413 aa  93.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  22.45 
 
 
409 aa  93.6  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
405 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  23.71 
 
 
394 aa  93.2  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 
422 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  27.23 
 
 
442 aa  90.1  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  25.75 
 
 
860 aa  90.1  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 
499 aa  90.1  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  22.08 
 
 
405 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  22.68 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  21.7 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  21.51 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  21.87 
 
 
415 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  22.05 
 
 
360 aa  86.7  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  21.63 
 
 
399 aa  86.7  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  21.87 
 
 
415 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  27.33 
 
 
1119 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  20.94 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 
429 aa  84  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  22.42 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  19.66 
 
 
956 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  21.34 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  22 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
535 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
994 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  22 
 
 
435 aa  79.7  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  19.76 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 
703 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  21.67 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  23.33 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0096  hypothetical protein  24.5 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 
1340 aa  76.6  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0105  hypothetical protein  24.65 
 
 
384 aa  76.3  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  22.09 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  20.96 
 
 
1156 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0563  hypothetical protein  24.1 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  23 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  21.58 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  20.82 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  22.27 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  21.23 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  21.23 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  20.49 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  20.7 
 
 
422 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  21.96 
 
 
391 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4239  hypothetical protein  23.08 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  26.67 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  22.6 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  20.65 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2185  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3256  hypothetical protein  23.13 
 
 
1199 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  22.25 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  23.75 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  20.56 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  23.17 
 
 
902 aa  67  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 
1075 aa  66.2  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  21.79 
 
 
824 aa  66.2  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  21.15 
 
 
414 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2865  hypothetical protein  23.08 
 
 
1199 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.739863  decreased coverage  0.00031468 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>